38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2452 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2452  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  258  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28130  hypothetical protein  96.49 
 
 		 114 aa  226  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00390916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4267  XRE family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043882  hitchhiker  0.0000172239 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0429  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4123  transcriptional regulator, XRE family  47.78 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1541  XRE family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000893114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4406  transcriptional regulator, XRE family  48.31 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2922  XRE family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 96 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  hitchhiker  0.000558445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0144  transcriptional regulator, XRE family  48.91 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000142855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0430  XRE family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00281269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4196  transcriptional regulator, XRE family  44.33 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4121  transcriptional regulator, XRE family  47.56 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00277725  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3154  XRE family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000123737  hitchhiker  0.00000000000122255 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4266  XRE family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773837  hitchhiker  0.00000479642 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6488  transcriptional regulator, XRE family  44.94 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3859  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0153162 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6926  XRE family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1513  transcriptional regulator, XRE family  49.35 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0145  transcriptional regulator, XRE family  50.72 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1691  transcriptional regulator, XRE family  46.75 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1692  transcriptional regulator, XRE family  46.75 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5932  transcriptional regulator, XRE family  39.56 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3224  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  43.59 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3425  transcriptional regulator, XRE family  42.5 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0260423  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6784  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2553  DNA-binding transcriptional regulator  42.5 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3494  I C protein  41 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4126  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3724  DNA binding protein  40.54 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1497  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1512  putative transcriptional regulator  49.15 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1498  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  32.65 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2141  helix-turn-helix domain protein  47.27 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  28.41 
 
 		 255 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>