155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3113 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  746    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  87.98 
 
 		 387 aa  590  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  35.62 
 
 		 380 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  33.17 
 
 		 497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  35.75 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  36.75 
 
 		 395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  42.49 
 
 		 422 aa  123  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  34.82 
 
 		 421 aa  123  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  38.02 
 
 		 463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  41.45 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  35.92 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  35.69 
 
 		 374 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  40.18 
 
 		 439 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  36.2 
 
 		 418 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  32.68 
 
 		 431 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  33.82 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  38.34 
 
 		 405 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  36.49 
 
 		 431 aa  99.4  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  33.33 
 
 		 564 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  36.77 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  27.38 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  34.27 
 
 		 561 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  35.42 
 
 		 432 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  38.63 
 
 		 415 aa  96.3  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  26.44 
 
 		 443 aa  96.3  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  31.75 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  30 
 
 		 407 aa  93.2  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  42.15 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  34.55 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  34.44 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  34.48 
 
 		 423 aa  89.4  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  33.18 
 
 		 479 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  36.33 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  36.09 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  33.62 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  31.3 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  23.11 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  31.69 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  32.86 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  35.37 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  32.42 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  34.95 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  36 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  32.42 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  37.18 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  26.51 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  35.85 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  33.13 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  20.7 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  27.85 
 
 		 491 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  29.56 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  30.97 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  21.52 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  26.98 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  33.99 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  29.54 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  29.03 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  25.1 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  27.42 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2147  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  26.9 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  32.93 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  31.25 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  36.94 
 
 		 333 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  32.05 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  34.3 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  34.45 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2826  protein of unknown function DUF58  36.36 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.493704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  26.49 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299067  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  31.37 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 446 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  31.9 
 
 		 546 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  24.6 
 
 		 458 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  28.45 
 
 		 451 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  23.48 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  28.36 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  33.59 
 
 		 449 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  33.59 
 
 		 449 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  33.59 
 
 		 449 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  35.58 
 
 		 426 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  22.12 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  31.46 
 
 		 455 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  29.1 
 
 		 641 aa  52.8  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  28.1 
 
 		 412 aa  53.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  27.22 
 
 		 440 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  28.9 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  32.14 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  47.62 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  46.03 
 
 		 454 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  21.51 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  24.88 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  26.3 
 
 		 828 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  30.91 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  30.16 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  33.14 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  32.98 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  27.35 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>