130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1561 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  100 
 
 		 1406 aa  2732    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  33.43 
 
 		 1392 aa  654    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  32.39 
 
 		 1398 aa  589  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1500 aa  182  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1395 aa  171  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  32.08 
 
 		 1276 aa  162  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1362 aa  158  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1396 aa  155  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1276 aa  152  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1276 aa  152  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  35.24 
 
 		 1084 aa  151  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1428 aa  149  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  29.11 
 
 		 1550 aa  145  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  28.44 
 
 		 1405 aa  144  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1869 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  28.94 
 
 		 1441 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  33.53 
 
 		 1538 aa  140  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1462 aa  141  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1783 aa  140  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1423 aa  140  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  31.41 
 
 		 1206 aa  138  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1404 aa  135  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  30.27 
 
 		 2032 aa  135  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  30.3 
 
 		 2140 aa  135  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  33.08 
 
 		 1937 aa  133  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  30.89 
 
 		 1463 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1451 aa  128  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1270 aa  127  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  31.29 
 
 		 1448 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1550 aa  124  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1335 aa  122  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  31.88 
 
 		 1530 aa  120  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1515 aa  112  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1487 aa  110  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1510 aa  110  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  31.92 
 
 		 1424 aa  107  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1578 aa  105  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1448 aa  103  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1319 aa  97.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1489 aa  94.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1443 aa  91.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1056 aa  90.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1377 aa  79.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1256 aa  78.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1369 aa  78.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1401 aa  76.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1434 aa  76.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1505 aa  75.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1463 aa  73.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1392 aa  72.4  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1135  hypothetical protein  24.46 
 
 		 859 aa  69.7  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1453 aa  69.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1346 aa  68.6  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1448 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1453 aa  67  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2805  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1317 aa  65.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1361 aa  64.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1473 aa  65.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  24.65 
 
 		 1304 aa  63.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  24.65 
 
 		 1304 aa  63.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  24.74 
 
 		 1359 aa  62.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  27.35 
 
 		 1507 aa  62.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  27.35 
 
 		 1507 aa  62.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1504 aa  62  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  25.32 
 
 		 1485 aa  62  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1184 aa  60.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1290 aa  60.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  23.73 
 
 		 1184 aa  60.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1346 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1372 aa  59.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  29.84 
 
 		 1025 aa  59.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1372 aa  58.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1372 aa  58.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1372 aa  58.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1372 aa  58.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1372 aa  58.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1372 aa  58.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1319 aa  57.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1352 aa  57  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1265 aa  57.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  21.16 
 
 		 1304 aa  56.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  24.3 
 
 		 1485 aa  56.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  23.63 
 
 		 1299 aa  55.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  23.7 
 
 		 1443 aa  56.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1375 aa  54.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  24.14 
 
 		 929 aa  54.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  24.07 
 
 		 929 aa  54.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  24.12 
 
 		 1243 aa  53.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1435 aa  54.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  28.03 
 
 		 1254 aa  54.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1262 aa  53.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0698  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1310 aa  53.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1292 aa  53.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1297 aa  52.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1308 aa  52  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  23.89 
 
 		 1378 aa  52  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0253  protein of unknown function DUF490  22.44 
 
 		 1503 aa  51.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1380 aa  51.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1353 aa  51.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1360 aa  50.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>