70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1017 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1017  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  100 
 
 		 1270 aa  2593    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000312457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.97 
 
 		 1686 aa  331  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.31 
 
 		 1482 aa  324  8e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.54 
 
 		 1669 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.59 
 
 		 1590 aa  302  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.07 
 
 		 1627 aa  293  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.82 
 
 		 1296 aa  275  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.09 
 
 		 1288 aa  272  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.35 
 
 		 1299 aa  269  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1895 aa  266  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.59 
 
 		 1488 aa  258  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.94 
 
 		 1281 aa  240  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1536  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.48 
 
 		 1568 aa  227  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2557  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  30.31 
 
 		 1946 aa  201  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  25.25 
 
 		 1714 aa  198  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  27.93 
 
 		 1581 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  26.92 
 
 		 1215 aa  117  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  26.92 
 
 		 1228 aa  116  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  26.37 
 
 		 991 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  26.69 
 
 		 1214 aa  112  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  26.69 
 
 		 1225 aa  112  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1014 aa  110  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27.76 
 
 		 1181 aa  101  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.49 
 
 		 1227 aa  100  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  26 
 
 		 1309 aa  99.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  23.92 
 
 		 1521 aa  99  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  22.86 
 
 		 1470 aa  99  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  23.74 
 
 		 1521 aa  97.4  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.49 
 
 		 1158 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.72 
 
 		 1122 aa  93.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.18 
 
 		 1155 aa  92.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.84 
 
 		 1115 aa  92  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.72 
 
 		 1122 aa  90.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  24.56 
 
 		 1493 aa  84  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.32 
 
 		 1245 aa  82.8  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  24.18 
 
 		 1544 aa  81.6  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  23.69 
 
 		 1254 aa  80.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  23.56 
 
 		 1273 aa  79.7  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.86 
 
 		 1287 aa  78.2  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.29 
 
 		 1223 aa  78.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  22.14 
 
 		 1327 aa  76.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  24.53 
 
 		 1014 aa  77.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1169 aa  75.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  24.87 
 
 		 1174 aa  73.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  23.81 
 
 		 1200 aa  68.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1169 aa  66.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  20.89 
 
 		 1030 aa  63.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0672  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.65 
 
 		 1666 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0705474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0627  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  22.95 
 
 		 1722 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.53 
 
 		 1148 aa  61.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  21.62 
 
 		 1069 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.26 
 
 		 1722 aa  58.9  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  22.99 
 
 		 1378 aa  58.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.26 
 
 		 1723 aa  58.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  25.23 
 
 		 1127 aa  57.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  21.76 
 
 		 1378 aa  58.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.19 
 
 		 1717 aa  57  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  21.32 
 
 		 1067 aa  55.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  21.67 
 
 		 1545 aa  55.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.36 
 
 		 1500 aa  54.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.93 
 
 		 1658 aa  52  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  23 
 
 		 1323 aa  52  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  24.33 
 
 		 798 aa  51.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.7 
 
 		 1517 aa  50.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  25 
 
 		 1111 aa  50.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2663  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  23.27 
 
 		 1361 aa  49.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.81 
 
 		 1182 aa  48.9  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  22.56 
 
 		 1182 aa  47.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2883  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.45 
 
 		 1204 aa  45.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.66 
 
 		 1577 aa  45.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>