More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2926 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  100 
 
 		 375 aa  725    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  56.03 
 
 		 381 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  55.59 
 
 		 378 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  56.03 
 
 		 381 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  57.45 
 
 		 379 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  55.23 
 
 		 381 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  56.53 
 
 		 381 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  44.03 
 
 		 389 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  42.82 
 
 		 381 aa  298  9e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  47.47 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  47.57 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  46.38 
 
 		 376 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  43.43 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  44.77 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  41.33 
 
 		 379 aa  262  8e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  37.5 
 
 		 385 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  40.11 
 
 		 391 aa  242  6e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  43.11 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  38.73 
 
 		 389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  37.53 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  32.71 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  33.07 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  32.71 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  32.71 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  36.41 
 
 		 371 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  34.27 
 
 		 395 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  33.51 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  32.98 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  32.98 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  31.95 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  32.98 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  32.71 
 
 		 372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  32.71 
 
 		 372 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  32.71 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  32.71 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  33.89 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  33.42 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  35.73 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  32.71 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  33.16 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  32.45 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  33.42 
 
 		 372 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  31.71 
 
 		 391 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  33.16 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  33.51 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  33.16 
 
 		 372 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  37.03 
 
 		 384 aa  182  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  35.4 
 
 		 391 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  37.64 
 
 		 383 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  33.6 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  38.67 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  33.14 
 
 		 380 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  33.42 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 363 aa  135  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  35.09 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  33.16 
 
 		 392 aa  126  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  32.42 
 
 		 366 aa  123  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  29.52 
 
 		 452 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  33.82 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  30.87 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  29.8 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  29.95 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 398 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  23.39 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 378 aa  86.3  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08446  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4607  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1840  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  28.74 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  25.42 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  25.95 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.656567 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05050  conserved hypothetical protein  25.18 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  26.53 
 
 		 446 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2605  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.83 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  27.55 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>