More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0731 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0731  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
407 aa  780    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.415998  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.25 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  38.84 
 
 
379 aa  216  5e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 
423 aa  212  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.69 
 
 
366 aa  202  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  37.21 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  37.97 
 
 
374 aa  199  6e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  39.7 
 
 
396 aa  196  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  37.39 
 
 
403 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  38.46 
 
 
469 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.69 
 
 
399 aa  192  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.27 
 
 
384 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  32.15 
 
 
389 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  41.1 
 
 
369 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  38.44 
 
 
381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  43.55 
 
 
487 aa  189  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  38.41 
 
 
614 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.33 
 
 
513 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  39.88 
 
 
344 aa  187  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  38.17 
 
 
418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.28 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  41.06 
 
 
513 aa  184  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  41.06 
 
 
513 aa  184  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  37.27 
 
 
584 aa  184  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  36.53 
 
 
425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  37.26 
 
 
400 aa  182  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  39.87 
 
 
407 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  35.39 
 
 
466 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.95 
 
 
487 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  36.3 
 
 
459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5907  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.29 
 
 
424 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  37.62 
 
 
413 aa  180  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.83 
 
 
386 aa  180  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  36.88 
 
 
471 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  34.23 
 
 
459 aa  179  7e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  38.85 
 
 
386 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  37.38 
 
 
417 aa  179  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.56 
 
 
372 aa  179  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.83 
 
 
383 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  36.66 
 
 
396 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  39.93 
 
 
520 aa  177  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  36.64 
 
 
368 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.84 
 
 
375 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  39.14 
 
 
525 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  37.05 
 
 
375 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  37.42 
 
 
578 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  38.17 
 
 
515 aa  176  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  38.02 
 
 
418 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.41 
 
 
386 aa  176  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  37.63 
 
 
500 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  39.58 
 
 
588 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.74 
 
 
381 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  39.22 
 
 
500 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  34.36 
 
 
472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  34.42 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.51 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.92 
 
 
349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  34.36 
 
 
472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  41.44 
 
 
475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  38.67 
 
 
404 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  37.28 
 
 
501 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4948  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.65 
 
 
374 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  42.55 
 
 
476 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  35.05 
 
 
472 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.88 
 
 
368 aa  172  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  36.15 
 
 
504 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  39.78 
 
 
508 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  37.5 
 
 
398 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  36.65 
 
 
471 aa  172  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  38.33 
 
 
404 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.05 
 
 
426 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  42.8 
 
 
476 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  35.37 
 
 
452 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  38.26 
 
 
374 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  38.94 
 
 
516 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  37.04 
 
 
464 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  37.46 
 
 
420 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  42.39 
 
 
524 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  42.37 
 
 
476 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  39.8 
 
 
497 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  40.2 
 
 
514 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.62 
 
 
408 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  38.78 
 
 
412 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  39.19 
 
 
396 aa  171  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  37.72 
 
 
535 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  37.33 
 
 
402 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  34.62 
 
 
411 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  37.72 
 
 
471 aa  170  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.67 
 
 
401 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  36.64 
 
 
453 aa  170  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  36.88 
 
 
387 aa  170  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  37.33 
 
 
401 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  37.05 
 
 
383 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  36.88 
 
 
395 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  32.52 
 
 
594 aa  169  6e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.33 
 
 
401 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  37.33 
 
 
379 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  38.51 
 
 
413 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  35.69 
 
 
372 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0667  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.87 
 
 
376 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>