208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0597 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  280  6.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  59.52 
 
 		 145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  55.12 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  41.67 
 
 		 135 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  49.04 
 
 		 294 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  45.69 
 
 		 167 aa  96.7  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  41.01 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  34.53 
 
 		 164 aa  88.6  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  41.35 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  39.42 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  39.53 
 
 		 183 aa  87.8  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  40.71 
 
 		 162 aa  87.4  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  36.22 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  40.15 
 
 		 178 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  40.15 
 
 		 168 aa  87  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  39.1 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  39.2 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  40.8 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  42.24 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  84.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  43.12 
 
 		 175 aa  84.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  39.2 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  39.2 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  39.85 
 
 		 161 aa  83.6  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  36 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  39.69 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  37.88 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  35.94 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  37.21 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  34.38 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  40.98 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  38.05 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  36.5 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  35.43 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  35.4 
 
 		 166 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  34.38 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  47.73 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  36.22 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  45.79 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  34.96 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  42.62 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  35.85 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  37.8 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  37.37 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  38.84 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  43.75 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  42.57 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  35.38 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  38.93 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  36.84 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  38.1 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  41.28 
 
 		 182 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  40.35 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  36.64 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  43.88 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  43.88 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  37.5 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  39.09 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  38.17 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  37.86 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  37.69 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  38.02 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  37.06 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  36.72 
 
 		 272 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.82 
 
 		 311 aa  71.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  36.36 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  37.21 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  37.93 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  36.11 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  40.34 
 
 		 238 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  38.17 
 
 		 230 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  38.93 
 
 		 231 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  36.5 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  42.02 
 
 		 238 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  35.45 
 
 		 205 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  37.69 
 
 		 174 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  37.06 
 
 		 160 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  38.17 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  35.14 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  29.23 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  42.72 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  42.72 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  39.71 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  41.05 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  35.78 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  36.96 
 
 		 237 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  43.96 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  40.82 
 
 		 324 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  36.43 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  31.3 
 
 		 271 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  35.61 
 
 		 239 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  41.18 
 
 		 235 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  36.96 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  33.9 
 
 		 245 aa  67  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  40.34 
 
 		 235 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0839  hypothetical protein  34 
 
 		 123 aa  67  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000606152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  37.08 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  32.03 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>