157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0446 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 498 aa  925    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  29.01 
 
 		 493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  30.38 
 
 		 470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  29.22 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  28.79 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  28.79 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  27.16 
 
 		 486 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  28.73 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  28.69 
 
 		 479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  29.76 
 
 		 471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  28.51 
 
 		 472 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  27.82 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  29.15 
 
 		 472 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  28.16 
 
 		 474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  27.91 
 
 		 480 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  27.27 
 
 		 474 aa  180  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  29.41 
 
 		 472 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  32.3 
 
 		 480 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  28.64 
 
 		 472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  32.76 
 
 		 506 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  26.25 
 
 		 476 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  28.61 
 
 		 471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  28.85 
 
 		 453 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  33.04 
 
 		 632 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  29.82 
 
 		 486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  30.93 
 
 		 549 aa  141  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  27.3 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  30.32 
 
 		 501 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  29.09 
 
 		 530 aa  113  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  26.12 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  29.85 
 
 		 575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  29.96 
 
 		 512 aa  110  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  32.89 
 
 		 646 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  29.34 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  29.03 
 
 		 527 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  25.15 
 
 		 504 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  31.91 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  24.15 
 
 		 504 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  28.46 
 
 		 491 aa  97.8  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  26.42 
 
 		 554 aa  97.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  28.81 
 
 		 609 aa  96.7  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  29.76 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 		 476 aa  95.1  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  33.05 
 
 		 519 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  34.01 
 
 		 547 aa  94.4  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  28.94 
 
 		 521 aa  94  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  30.43 
 
 		 504 aa  93.2  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  28.7 
 
 		 494 aa  92.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1490  membrane flanked domain-containing protein  19 
 
 		 472 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  19.6 
 
 		 501 aa  91.7  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  28.85 
 
 		 551 aa  91.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  29.86 
 
 		 511 aa  90.9  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  28.81 
 
 		 555 aa  91.3  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  18.48 
 
 		 472 aa  90.1  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  28.17 
 
 		 634 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  31.32 
 
 		 575 aa  88.2  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  27.74 
 
 		 489 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  29.61 
 
 		 673 aa  86.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  23.78 
 
 		 513 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  35.19 
 
 		 579 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  30.11 
 
 		 619 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  32.99 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  24.29 
 
 		 542 aa  84  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  27.03 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2110  membrane-flanked domain-containing protein  18.7 
 
 		 527 aa  81.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.961719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2148  membrane-flanked domain-containing protein  18.7 
 
 		 527 aa  81.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  33.69 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  33.09 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  26.88 
 
 		 554 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  23.1 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  28.78 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  22.43 
 
 		 514 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  29.17 
 
 		 507 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  23.97 
 
 		 522 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  20.2 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  30.08 
 
 		 501 aa  70.1  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  22.52 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  28.35 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  19.29 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  20.11 
 
 		 542 aa  60.5  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  28.38 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0985  hypothetical protein  30.83 
 
 		 114 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  30.88 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  31.78 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  37.5 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  35.29 
 
 		 700 aa  56.2  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  28.24 
 
 		 532 aa  56.6  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  36.89 
 
 		 766 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  24.63 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  29.29 
 
 		 177 aa  55.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  36.05 
 
 		 658 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  36.52 
 
 		 165 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  36.52 
 
 		 165 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21830  hypothetical protein  26.08 
 
 		 544 aa  54.7  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0642218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  36.52 
 
 		 165 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  36.73 
 
 		 558 aa  53.9  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  29.25 
 
 		 486 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  29.25 
 
 		 486 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  30.91 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  29.55 
 
 		 508 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>