More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0886 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  100 
 
 		 340 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  86.98 
 
 		 340 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  86.98 
 
 		 340 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  67.28 
 
 		 369 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  65.61 
 
 		 294 aa  363  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  63.18 
 
 		 297 aa  359  4e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  59.14 
 
 		 300 aa  325  5e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  44.94 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  42.47 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  44.44 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  45.96 
 
 		 290 aa  236  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  44.09 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  44.01 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  44.44 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  43.4 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  44.6 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  41.64 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  41.48 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  43.06 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  41.69 
 
 		 316 aa  220  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  42.09 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  43.23 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  43.23 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  42 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  44.74 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  42.67 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  44.76 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  43.98 
 
 		 295 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2799  HflC protein  43.36 
 
 		 321 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565333 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  36.99 
 
 		 289 aa  205  7e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  39.51 
 
 		 292 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  39.77 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  36.84 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2540  HflC protein  43.49 
 
 		 319 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713322  normal  0.756997 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  40.79 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  39.05 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  42.61 
 
 		 292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  38.16 
 
 		 295 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  39.79 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2816  HFLC protein  38.89 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.273715  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  39.04 
 
 		 289 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  36.79 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  38.64 
 
 		 283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  37.45 
 
 		 304 aa  189  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2017  HflC protein  39.94 
 
 		 310 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  37.46 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  38.04 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  37.4 
 
 		 283 aa  186  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  38.78 
 
 		 294 aa  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  33.74 
 
 		 335 aa  185  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  36.15 
 
 		 297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  39.64 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  38.21 
 
 		 300 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  37.72 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  32.52 
 
 		 334 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  36.79 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  32.52 
 
 		 334 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  37.76 
 
 		 283 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  37.27 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  32.52 
 
 		 334 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  33.33 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  35.47 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  35.47 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  34.88 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  32.39 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0358  FtsH protease regulator HflC  32.69 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  hitchhiker  0.00397927 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  33.8 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  38.32 
 
 		 303 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  36.62 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  34.71 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  32.69 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  32.69 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  35.96 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  37.46 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  32.69 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  32.69 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  32.69 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  32.69 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  32.69 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  32.69 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  32.69 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4782  FtsH protease regulator HflC  33.01 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  0.242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  37.89 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  38.25 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4725  FtsH protease regulator HflC  33.01 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4642  FtsH protease regulator HflC  33.01 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4761  FtsH protease regulator HflC  33.01 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4632  FtsH protease regulator HflC  33.01 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  31.45 
 
 		 331 aa  176  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  36.43 
 
 		 291 aa  176  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  33.57 
 
 		 283 aa  175  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  33.57 
 
 		 283 aa  175  8e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  37.31 
 
 		 290 aa  175  9.999999999999999e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  32.22 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  36.2 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  36.84 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1748  HflC protein  41.08 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224393  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  35.69 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  35.42 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  34.46 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>