65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0831 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  100 
 
 		 362 aa  747    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  98.98 
 
 		 294 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  49.17 
 
 		 375 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  36.99 
 
 		 370 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  34.83 
 
 		 344 aa  162  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  35.85 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  34.03 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  32.95 
 
 		 367 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  33.23 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  35.24 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  33.73 
 
 		 426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  34.32 
 
 		 344 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  34.64 
 
 		 385 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  34.4 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  35.77 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  31.47 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  28.42 
 
 		 297 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  27.65 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  28.92 
 
 		 361 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  31.89 
 
 		 250 aa  87.8  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  26.99 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  26.96 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  28.24 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  32.7 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  32.7 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  24.92 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1428  phage integrase family site specific recombinase  35.48 
 
 		 125 aa  65.1  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  34.01 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  25.88 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  34.4 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  25 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  25.66 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  25.28 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  27.43 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  26.16 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  28.65 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  27.36 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  24.82 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  24.64 
 
 		 349 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  26.75 
 
 		 351 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0569  integrase family protein  31.73 
 
 		 251 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0286562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  27.33 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  24.35 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  28.08 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0585  integrase family protein  30.3 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  23.83 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0776  hypothetical protein  27.54 
 
 		 188 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.371446 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0873  HbiF  27.54 
 
 		 188 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.102979  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0839  DNA recombinase HbiF  27.54 
 
 		 188 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  23.92 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  21.48 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  27.83 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0910  putative integrase  31.18 
 
 		 95 aa  43.1  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.690439  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  22.33 
 
 		 386 aa  43.1  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  26.56 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0507  site-specific recombinase, phage integrase family  24.24 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0835  site-specific recombinase, phage integrase family  24.24 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2397  site-specific recombinase, phage integrase family  24.24 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  29.13 
 
 		 340 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0669  integrase family protein  24.24 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0326  integrase family protein  24.24 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.061717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>