80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4696 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  100 
 
 		 236 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  70.76 
 
 		 236 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  71.19 
 
 		 235 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  63.45 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  63.45 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  63.45 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  67.09 
 
 		 232 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  58.33 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0687  TonB-like protein  61.61 
 
 		 225 aa  198  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  58.48 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  50.24 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  30.18 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  28.99 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  37.18 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3235  TonB family protein  46.81 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  34.21 
 
 		 245 aa  52  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  32.2 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  40 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1935  hypothetical protein  47.83 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.236063 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  29.49 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  29.49 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  38.6 
 
 		 292 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1758  hypothetical protein  46.81 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  35.06 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  31.65 
 
 		 267 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  32.53 
 
 		 668 aa  48.9  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  31.65 
 
 		 267 aa  48.9  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  31.65 
 
 		 267 aa  48.9  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  36.84 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  24.64 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  41.51 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  30.83 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  30.56 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  40.24 
 
 		 485 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  39.62 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  33.33 
 
 		 413 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  34.25 
 
 		 279 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  27.5 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  27.5 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  27.5 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  29.06 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  37.74 
 
 		 264 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  37.66 
 
 		 184 aa  45.1  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  35.06 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  34.21 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  30.38 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  25.64 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  30.53 
 
 		 447 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  27.73 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  33.33 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  37.74 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  30.3 
 
 		 2113 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  28.74 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  34.57 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1117  hypothetical protein  27.4 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  33.14 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  28.95 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  32.89 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  35.09 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  26.58 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  38.89 
 
 		 174 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  34.67 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  35.09 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  28.68 
 
 		 284 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  34.15 
 
 		 484 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  26.58 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  31.33 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2275  TonB family protein  32.14 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1922  TonB family protein  32.14 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  28.07 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  34.69 
 
 		 285 aa  42  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  32.89 
 
 		 248 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  31.58 
 
 		 112 aa  42  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  32.89 
 
 		 246 aa  42  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  32.89 
 
 		 246 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  32.89 
 
 		 246 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  30.33 
 
 		 244 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  32.89 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  30.33 
 
 		 244 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  32.89 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>