More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3114 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  100 
 
 		 230 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  78.18 
 
 		 252 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  68.64 
 
 		 230 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  76.47 
 
 		 246 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  66.36 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  66.82 
 
 		 230 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  66.99 
 
 		 226 aa  281  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  54.95 
 
 		 225 aa  221  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  60.55 
 
 		 225 aa  218  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  54.98 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  54.98 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  56.04 
 
 		 211 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  54.98 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  54.55 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  61.03 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  53.08 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  57.71 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  58.88 
 
 		 244 aa  208  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  56.73 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  53.14 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  60.2 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  56.73 
 
 		 217 aa  202  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  48.43 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  53.02 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  52.63 
 
 		 208 aa  191  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  52.15 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  55.45 
 
 		 233 aa  185  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  50 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  46.92 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  48.15 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1870  thymidylate kinase  50 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  44.34 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  50 
 
 		 211 aa  168  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  49.5 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  48.1 
 
 		 207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  50.53 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  45.73 
 
 		 703 aa  161  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  45.81 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  43.38 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  47.72 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  47.72 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  40.37 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  50 
 
 		 210 aa  158  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.66 
 
 		 207 aa  158  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  48.57 
 
 		 218 aa  157  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  45.73 
 
 		 705 aa  158  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  49.47 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  46.5 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  45.69 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  39.91 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  49.48 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  49.24 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  39.25 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  48.22 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  39.8 
 
 		 212 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  45.24 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  47.12 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  48.28 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  43.81 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  43.87 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  46.94 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  42.51 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  44.88 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  44.16 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  44.24 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  48.99 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  46.94 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  43.32 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 207 aa  147  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  41.44 
 
 		 233 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  43.84 
 
 		 208 aa  147  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  49.3 
 
 		 210 aa  147  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  45.24 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  44.08 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  44.59 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  42.01 
 
 		 686 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  41.31 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  44.22 
 
 		 202 aa  144  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  39.32 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  43.92 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  37.26 
 
 		 209 aa  144  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  41.5 
 
 		 901 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  42.66 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  38.6 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  42.65 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  44.22 
 
 		 203 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 217 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  45.63 
 
 		 217 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  42.29 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  45.73 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 688 aa  142  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  43.46 
 
 		 217 aa  141  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  35.05 
 
 		 213 aa  141  9e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>