167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0471 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
380 aa  778    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  81.58 
 
 
374 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  77.75 
 
 
373 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  78.78 
 
 
329 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0425  perplasmic binding protein of ABC transporter  80.25 
 
 
341 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0570  ABC transporter periplasmic-binding protein  78.98 
 
 
339 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0331  perplasmic binding protein of ABC transporter  68.78 
 
 
344 aa  508  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.18125  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  59.55 
 
 
344 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  57.14 
 
 
352 aa  401  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  55.73 
 
 
339 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1384  permease protein of ABC transporter  54.4 
 
 
333 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178302  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  54.37 
 
 
338 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  52.92 
 
 
338 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3143  perplasmic binding protein of ABC transporter  54.02 
 
 
351 aa  350  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786011  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5136  NMT1/THI5 like domain protein  53.38 
 
 
342 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3687  ABC transporter substrate-binding protein  51.62 
 
 
351 aa  332  6e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1471  permease protein of ABC transporter  49.04 
 
 
332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  49.34 
 
 
345 aa  327  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  45.31 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  46.47 
 
 
336 aa  298  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  40.74 
 
 
336 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.39 
 
 
343 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0799  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.48 
 
 
336 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  39.49 
 
 
326 aa  248  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  41.47 
 
 
328 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  42.21 
 
 
337 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  42.47 
 
 
342 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  39.33 
 
 
322 aa  236  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  39.67 
 
 
322 aa  235  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  39 
 
 
322 aa  233  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  37.83 
 
 
314 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  37.83 
 
 
328 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  38.36 
 
 
328 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.5 
 
 
328 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.33 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  30.87 
 
 
364 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  30.53 
 
 
347 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.24 
 
 
342 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
915 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.84 
 
 
344 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  26.18 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.7 
 
 
1075 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.23 
 
 
323 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.3 
 
 
345 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  25.33 
 
 
674 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.6 
 
 
1004 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  23.74 
 
 
721 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  23.83 
 
 
1065 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  23.55 
 
 
686 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  24.75 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  26.5 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.14 
 
 
1004 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  24.19 
 
 
593 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  25.67 
 
 
821 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  23.36 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  25.69 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.45 
 
 
1238 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  28.7 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  29.6 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  24.43 
 
 
775 aa  72  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  27.51 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  23.96 
 
 
856 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  22.85 
 
 
794 aa  69.7  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  23.95 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  23.93 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5692  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.18 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  29.24 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  29.24 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.83 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  23.76 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1302  NMT1/THI5 like domain protein  23.36 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0447941  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  29.02 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.89 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  22.58 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  28.76 
 
 
326 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  23.39 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.8 
 
 
330 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.92 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.72 
 
 
332 aa  64.3  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  27.63 
 
 
329 aa  63.5  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  21.2 
 
 
336 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  23.51 
 
 
893 aa  63.2  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  21.65 
 
 
357 aa  63.2  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  24.33 
 
 
327 aa  62.8  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  25.08 
 
 
325 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.57 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.52 
 
 
335 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.26 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  24.69 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13660  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  23.15 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  25.95 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  21.4 
 
 
331 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.28 
 
 
328 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  28.12 
 
 
336 aa  60.5  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  20.2 
 
 
328 aa  60.1  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  23.38 
 
 
331 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3625  hypothetical protein  22.9 
 
 
379 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.83 
 
 
335 aa  60.1  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
378 aa  60.1  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>