253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2979 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  100 
 
 
323 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.89 
 
 
331 aa  196  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5692  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.24 
 
 
360 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  36.02 
 
 
365 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  32.31 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  32.33 
 
 
335 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  32.21 
 
 
331 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  33.33 
 
 
357 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  30.74 
 
 
354 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  29.27 
 
 
348 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1302  NMT1/THI5 like domain protein  32.78 
 
 
364 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0447941  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
915 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
342 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  27.71 
 
 
686 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  28.57 
 
 
674 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.04 
 
 
1075 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  29.95 
 
 
344 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  31.05 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  32.09 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  26.46 
 
 
375 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  30.98 
 
 
323 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.15 
 
 
330 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.95 
 
 
335 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  31.72 
 
 
323 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  27.8 
 
 
381 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  31.3 
 
 
338 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  27.7 
 
 
593 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  28.63 
 
 
330 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.72 
 
 
329 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  30.4 
 
 
329 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.31 
 
 
332 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  28 
 
 
778 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  31.82 
 
 
334 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.51 
 
 
328 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140791  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.03 
 
 
1238 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  29.64 
 
 
326 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  31.36 
 
 
334 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  30.3 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  30.3 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.13 
 
 
346 aa  96.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  28.23 
 
 
329 aa  95.9  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  31.56 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  32.23 
 
 
380 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  26.38 
 
 
365 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  29.72 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.55 
 
 
1004 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 
1004 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  29.37 
 
 
336 aa  94.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.42 
 
 
343 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.03 
 
 
344 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.63 
 
 
326 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  25.71 
 
 
721 aa  92.8  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  29.27 
 
 
333 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.94 
 
 
333 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.16 
 
 
337 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  28.36 
 
 
359 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.27 
 
 
333 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  29.27 
 
 
333 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.27 
 
 
333 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  29.27 
 
 
333 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  29.27 
 
 
333 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  26.7 
 
 
357 aa  89.7  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.34 
 
 
333 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.34 
 
 
333 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  29.11 
 
 
336 aa  89  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  28.86 
 
 
333 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.34 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.89 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  23.63 
 
 
856 aa  87.8  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  22.75 
 
 
1065 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.8 
 
 
335 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  29.2 
 
 
382 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0570  ABC transporter periplasmic-binding protein  29.96 
 
 
339 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  27.31 
 
 
821 aa  87  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  30.33 
 
 
329 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.44 
 
 
322 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  27.97 
 
 
339 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  28.9 
 
 
339 aa  85.9  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  27.44 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  23.96 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  25.76 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  24.72 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  28.26 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  26.98 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.22 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0331  perplasmic binding protein of ABC transporter  29.88 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.18125  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  29.72 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0425  perplasmic binding protein of ABC transporter  29.48 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.02 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.13 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  27.35 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1384  permease protein of ABC transporter  29.05 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178302  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  27.57 
 
 
342 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  26.84 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  24.77 
 
 
364 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  25.96 
 
 
385 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  28.91 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  31.44 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  29.27 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.23 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>