140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1471 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1471  permease protein of ABC transporter  100 
 
 		 332 aa  678    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1384  permease protein of ABC transporter  58.61 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  51.38 
 
 		 329 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  51.1 
 
 		 339 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  49.04 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  50.64 
 
 		 373 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0425  perplasmic binding protein of ABC transporter  50.76 
 
 		 341 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  49.68 
 
 		 374 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0331  perplasmic binding protein of ABC transporter  51.1 
 
 		 344 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.18125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0570  ABC transporter periplasmic-binding protein  48.29 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  49.67 
 
 		 338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  46.71 
 
 		 352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  48.51 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  51.61 
 
 		 346 aa  301  9e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  47.17 
 
 		 344 aa  299  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3143  perplasmic binding protein of ABC transporter  49.51 
 
 		 351 aa  298  7e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786011  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3687  ABC transporter substrate-binding protein  49.67 
 
 		 351 aa  295  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5136  NMT1/THI5 like domain protein  48.21 
 
 		 342 aa  288  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  43.83 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  42.34 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  43.92 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  40.67 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.07 
 
 		 343 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0799  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.13 
 
 		 336 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.38 
 
 		 326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  42.18 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  40.68 
 
 		 314 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  37.71 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  41 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  38.05 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.37 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  40.82 
 
 		 328 aa  209  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  41.92 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  40.48 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.35 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  32.35 
 
 		 347 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  28.32 
 
 		 364 aa  129  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  25.32 
 
 		 856 aa  87  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  28.7 
 
 		 674 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.08 
 
 		 1004 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 915 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  27.01 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  36.61 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.41 
 
 		 1004 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  25.55 
 
 		 593 aa  69.7  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.01 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  24.58 
 
 		 1065 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.58 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.95 
 
 		 1075 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.68 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  26.57 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  25 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  31.29 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.64 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  26.67 
 
 		 778 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  23.46 
 
 		 893 aa  63.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17290  hypothetical protein  25.57 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.047766  normal  0.203711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  33.9 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3787  hypothetical protein  24.71 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.036851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  24.57 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  28.98 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  22.26 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  29.07 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  28.05 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  25.1 
 
 		 686 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  28.05 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  24.25 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.12 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  22.17 
 
 		 821 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  21.63 
 
 		 721 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.53 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  34.52 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  25.87 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  28.48 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.83 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  31.43 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  22.8 
 
 		 794 aa  57.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.77 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0260  hypothetical protein  24.74 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.96 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  31.82 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  25.6 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  23.24 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.07 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  23.34 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2282  hypothetical protein  22.99 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.96 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.74 
 
 		 1238 aa  53.9  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  30.11 
 
 		 385 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  20.5 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.46 
 
 		 347 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  23.08 
 
 		 775 aa  53.1  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.67 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  24.89 
 
 		 357 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  23.46 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.68 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  21.88 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  28.68 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  28.68 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.68 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>