249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2024 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
344 aa  711    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  61.11 
 
 
357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0856  hypothetical protein  58.28 
 
 
342 aa  391  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.028683  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1033  hypothetical protein  57.4 
 
 
342 aa  386  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152767  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  49.02 
 
 
324 aa  332  5e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1583  NMT1/THI5 like domain protein  41.57 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  37.5 
 
 
334 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.99 
 
 
329 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  36.99 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  37.88 
 
 
330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  36.4 
 
 
329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  36.88 
 
 
336 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.05 
 
 
330 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  37.67 
 
 
329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.27 
 
 
332 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  36.53 
 
 
326 aa  162  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  34.35 
 
 
326 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  34.35 
 
 
326 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  34.56 
 
 
326 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  33.12 
 
 
323 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.05 
 
 
328 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140791  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  35.5 
 
 
323 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  34.74 
 
 
336 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  32.5 
 
 
361 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  30.77 
 
 
359 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.36 
 
 
335 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  32.36 
 
 
382 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  32.75 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  31.97 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  27.82 
 
 
674 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 
1004 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.02 
 
 
1238 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 
1004 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  29.18 
 
 
856 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  28.12 
 
 
375 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  30.04 
 
 
1065 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
915 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  28.63 
 
 
794 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4039  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  28.47 
 
 
343 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  29 
 
 
721 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  28.37 
 
 
686 aa  97.4  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  27.33 
 
 
327 aa  95.9  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.35 
 
 
336 aa  95.9  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.9 
 
 
332 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.9 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  26.62 
 
 
821 aa  95.1  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.9 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  24.37 
 
 
593 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.71 
 
 
332 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.11 
 
 
1075 aa  94.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.46 
 
 
332 aa  93.6  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  25.54 
 
 
332 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  25.54 
 
 
332 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  25.54 
 
 
332 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  25.54 
 
 
332 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  27.24 
 
 
350 aa  93.6  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.54 
 
 
332 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  27.15 
 
 
360 aa  93.2  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.54 
 
 
332 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.09 
 
 
328 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  27.72 
 
 
342 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  27.43 
 
 
318 aa  87  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.35 
 
 
329 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  23.93 
 
 
331 aa  85.9  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  26.72 
 
 
327 aa  85.9  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  27.07 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.07 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  26.97 
 
 
778 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  26.14 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.62 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.41 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  26.94 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  28.21 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.31 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  27.27 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  27.78 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.97 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  23.63 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  23.63 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  25.2 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.63 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.97 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  24.68 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.27 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.63 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  23.63 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  25.2 
 
 
775 aa  72.8  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  23.63 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  26.19 
 
 
322 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.71 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.71 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.35 
 
 
323 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0477  NMT1/THI5 like domain protein  27.38 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  25.71 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.71 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  25.48 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.89 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  24.36 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.33 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>