173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2101 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
327 aa  659    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  34.89 
 
 
323 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  30.84 
 
 
323 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  27.33 
 
 
344 aa  95.9  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  30.33 
 
 
674 aa  95.9  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  30.38 
 
 
336 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.41 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  33.47 
 
 
329 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  25.71 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.7 
 
 
330 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  32.49 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  32.59 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 
1004 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  33.47 
 
 
334 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.4 
 
 
332 aa  86.3  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  30.58 
 
 
326 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  30.58 
 
 
326 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.47 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 
1004 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.54 
 
 
1075 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.74 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140791  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  32.64 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  26.42 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  27.74 
 
 
1065 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.87 
 
 
1238 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.62 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  31.11 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  32.58 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  27 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0392  NMT1/THI5 like domain protein  28.82 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  28.76 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  27.01 
 
 
821 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  27.91 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  26.71 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.05 
 
 
336 aa  77  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  26.52 
 
 
893 aa  75.9  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
915 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  26.62 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  23.81 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  26.59 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.37 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.55 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  26.98 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  26.18 
 
 
721 aa  73.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  24.3 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  27.65 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.65 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  25.75 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  27.65 
 
 
794 aa  72.4  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  25.16 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  25.4 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  26.86 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.32 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.43 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  24.05 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1033  hypothetical protein  25 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152767  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  28.8 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  24.17 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  25.53 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  25.93 
 
 
381 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.37 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  24.91 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.25 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0856  hypothetical protein  25 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.028683  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  26.19 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.7 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.51 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  26.67 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.76 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  26.44 
 
 
856 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  23.66 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  25.23 
 
 
778 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.51 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  26 
 
 
350 aa  63.9  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  25.48 
 
 
380 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  26.07 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  26.03 
 
 
339 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  25.25 
 
 
342 aa  63.5  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  27.52 
 
 
342 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  23.73 
 
 
347 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  26.25 
 
 
373 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  27.31 
 
 
348 aa  63.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  25.75 
 
 
335 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  23.76 
 
 
338 aa  62.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  26.14 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.77 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  22.6 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.6 
 
 
333 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26 
 
 
333 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  25.2 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  25.2 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.11 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.16 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.06 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.53 
 
 
362 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  26.16 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  26.01 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>