226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2036 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  98.14 
 
 		 322 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 		 322 aa  649    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  97.33 
 
 		 322 aa  600  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  43.67 
 
 		 345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.85 
 
 		 346 aa  262  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.34 
 
 		 326 aa  258  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  42.02 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0799  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.76 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  42.33 
 
 		 352 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  38.87 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  39.34 
 
 		 380 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  40.91 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  41.38 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0425  perplasmic binding protein of ABC transporter  41.99 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  40.07 
 
 		 374 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0331  perplasmic binding protein of ABC transporter  40.99 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.18125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0570  ABC transporter periplasmic-binding protein  41.01 
 
 		 339 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  39.6 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3687  ABC transporter substrate-binding protein  41.83 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  38.8 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3143  perplasmic binding protein of ABC transporter  39.07 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786011  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1471  permease protein of ABC transporter  38.08 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  38.87 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5136  NMT1/THI5 like domain protein  38.28 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  37.54 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  39.87 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.87 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1384  permease protein of ABC transporter  37.93 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.61 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  39.14 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  38.73 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.41 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  37.09 
 
 		 342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.56 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.85 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  34.4 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  26.64 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 		 1004 aa  96.3  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  29.41 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 		 1004 aa  92.4  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 915 aa  90.5  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  28.74 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  29.11 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  26.38 
 
 		 674 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  27.01 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  24.92 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.53 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  24.05 
 
 		 856 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.23 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.2 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  27.16 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.95 
 
 		 1238 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.7 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1583  NMT1/THI5 like domain protein  29.6 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  28.74 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  26.79 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.5 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  29.6 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.96 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.86 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  24.92 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.71 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  35.29 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.64 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.87 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  27.46 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.24 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.12 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  26.82 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  26.88 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  27.61 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  26.36 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  26.64 
 
 		 593 aa  73.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  26.18 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  26.25 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  25.31 
 
 		 775 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  29.3 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  23.51 
 
 		 721 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  25.1 
 
 		 794 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  26.17 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  24.76 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.44 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  25.94 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.07 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  25.72 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  24.06 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  25.9 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3091  hypothetical protein  24.18 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  25.3 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  26.28 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  24.44 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.16 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  27.88 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  23.86 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  26.48 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.75 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.59 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  21.79 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  22.75 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.75 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>