172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3874 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  100 
 
 
336 aa  684    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5136  NMT1/THI5 like domain protein  57.05 
 
 
342 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3143  perplasmic binding protein of ABC transporter  56.09 
 
 
351 aa  363  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786011  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3687  ABC transporter substrate-binding protein  54.14 
 
 
351 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  48.78 
 
 
344 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  46.47 
 
 
380 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  44.85 
 
 
329 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  48.89 
 
 
339 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0570  ABC transporter periplasmic-binding protein  47.16 
 
 
339 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  48.55 
 
 
352 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1384  permease protein of ABC transporter  46.13 
 
 
333 aa  288  7e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178302  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  46.01 
 
 
373 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0425  perplasmic binding protein of ABC transporter  47.6 
 
 
341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  47.32 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  45.81 
 
 
374 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  46.71 
 
 
338 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0331  perplasmic binding protein of ABC transporter  46.57 
 
 
344 aa  277  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.18125  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1471  permease protein of ABC transporter  42.34 
 
 
332 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  45.07 
 
 
345 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  42.41 
 
 
336 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  40.89 
 
 
346 aa  245  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  41.28 
 
 
328 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.21 
 
 
343 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  41.9 
 
 
337 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  42.47 
 
 
342 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  40.91 
 
 
314 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  41.31 
 
 
328 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  40.97 
 
 
328 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  40.2 
 
 
326 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0799  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.05 
 
 
336 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  40.97 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  37.09 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  37.81 
 
 
322 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.67 
 
 
322 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  34.13 
 
 
364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  30.39 
 
 
347 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.15 
 
 
322 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  28.76 
 
 
375 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 
915 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.69 
 
 
1004 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  26.27 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.52 
 
 
344 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  25.24 
 
 
856 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  23.77 
 
 
794 aa  79.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 
1004 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.36 
 
 
1075 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  26.28 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.05 
 
 
1238 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  27.07 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  26.21 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  24.53 
 
 
1065 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  24.15 
 
 
893 aa  72.8  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  25.12 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  25.72 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  27.41 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  23.46 
 
 
821 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  25.48 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.9 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  28 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.91 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  25.93 
 
 
775 aa  68.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  24.37 
 
 
593 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.98 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  30.57 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  28 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  27.08 
 
 
674 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  25.51 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  24.56 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  24.56 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  24.56 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  24.56 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.56 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.56 
 
 
332 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.56 
 
 
332 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
339 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.56 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.28 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3787  hypothetical protein  23.19 
 
 
392 aa  65.9  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.036851  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  25.24 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.56 
 
 
332 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  20.67 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.64 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  25.96 
 
 
344 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.11 
 
 
336 aa  63.5  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.69 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.65 
 
 
336 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.86 
 
 
332 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.28 
 
 
347 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  24.48 
 
 
357 aa  62.8  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  27.41 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  24.25 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  23.88 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  23.78 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5692  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.47 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  24.5 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  26.72 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.22 
 
 
336 aa  59.7  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.18 
 
 
332 aa  59.7  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.8 
 
 
342 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>