285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2049 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  98.18 
 
 		 329 aa  656    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 		 334 aa  678    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  95.81 
 
 		 334 aa  617  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  72.53 
 
 		 329 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  72.53 
 
 		 330 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  68.69 
 
 		 330 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  70.12 
 
 		 332 aa  464  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  71.71 
 
 		 326 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  70.72 
 
 		 326 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  70.72 
 
 		 326 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  70.98 
 
 		 329 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  72.22 
 
 		 328 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  64.74 
 
 		 326 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  64 
 
 		 323 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  63.41 
 
 		 336 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  62.42 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  65.56 
 
 		 323 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  61.82 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4039  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  42.94 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  38.77 
 
 		 378 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  39.31 
 
 		 359 aa  195  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  38.02 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  36.62 
 
 		 357 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  37.89 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  36.88 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  37.59 
 
 		 344 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  35.45 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1583  NMT1/THI5 like domain protein  33.79 
 
 		 338 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0856  hypothetical protein  33.44 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.028683  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1033  hypothetical protein  33.11 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152767  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 915 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 674 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  32.35 
 
 		 375 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  29.71 
 
 		 821 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.01 
 
 		 1238 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 		 1004 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  31.35 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 1004 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  30.64 
 
 		 686 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  33.88 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  28.8 
 
 		 593 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.09 
 
 		 1075 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  30.97 
 
 		 778 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.54 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  26.71 
 
 		 1065 aa  99.8  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  30.42 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  28.72 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.98 
 
 		 335 aa  96.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  30.13 
 
 		 775 aa  95.9  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.64 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.37 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  30.12 
 
 		 856 aa  92.8  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.43 
 
 		 342 aa  92.4  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  29.01 
 
 		 360 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  29.18 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  28.85 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  28.74 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.62 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  32.59 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  29.25 
 
 		 311 aa  90.1  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.12 
 
 		 322 aa  89.7  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.12 
 
 		 322 aa  89.4  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  32.31 
 
 		 314 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  27.95 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.33 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  29.01 
 
 		 794 aa  89  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  29.96 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3018  NMT1/THI5 like domain protein  28.25 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  29.71 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  29.96 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.54 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  28.12 
 
 		 329 aa  87  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  29.59 
 
 		 331 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  27.86 
 
 		 721 aa  86.3  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.56 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.84 
 
 		 336 aa  85.9  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  28.68 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  27.5 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  27.5 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  27.5 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  27.5 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.5 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.5 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  30.58 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  28.97 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  27.24 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  29.84 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.14 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  25.85 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.41 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  26.79 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.85 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.74 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.74 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.74 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  28.17 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  28.74 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.74 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.79 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>