238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0121 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 
356 aa  727    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  63.56 
 
 
350 aa  489  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  36.22 
 
 
336 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  35.58 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  32.42 
 
 
360 aa  182  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3018  NMT1/THI5 like domain protein  36.68 
 
 
342 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1669  NMT1/THI5 like domain protein  38.71 
 
 
360 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.833326  normal  0.535701 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  35.57 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  32.88 
 
 
331 aa  152  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  34.22 
 
 
327 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.97 
 
 
329 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  35.52 
 
 
336 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  33.33 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  37.5 
 
 
318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.55 
 
 
332 aa  146  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.85 
 
 
332 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  33.12 
 
 
339 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  32.79 
 
 
332 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  33.88 
 
 
332 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  33.55 
 
 
332 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  33.22 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  33.22 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  33.22 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  33.22 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  33.22 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  33.22 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.18 
 
 
340 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1941  NMT1/THI5 like domain protein  30.97 
 
 
315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.876036  hitchhiker  0.000270678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4670  NMT1/THI5 like domain protein  29.96 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.46 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  33.46 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13660  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  31.01 
 
 
349 aa  123  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0477  NMT1/THI5 like domain protein  33.08 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.57 
 
 
333 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  30.12 
 
 
328 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  29.12 
 
 
333 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  29.12 
 
 
333 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.12 
 
 
333 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.77 
 
 
333 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.12 
 
 
333 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4256  NMT1/THI5 like domain protein  27.67 
 
 
351 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.57 
 
 
333 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.77 
 
 
333 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  28.77 
 
 
333 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  28.77 
 
 
333 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.77 
 
 
333 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0392  NMT1/THI5 like domain protein  30.43 
 
 
351 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  30.48 
 
 
338 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  26.82 
 
 
349 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  28.22 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.7 
 
 
342 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.66 
 
 
341 aa  86.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  28.25 
 
 
315 aa  85.9  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.05 
 
 
329 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.7 
 
 
1238 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  27.13 
 
 
674 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  28.03 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  28.63 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  27.68 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  27.31 
 
 
334 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  26.89 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  24.3 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  24.92 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  27.08 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  25 
 
 
1065 aa  80.1  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  24.11 
 
 
375 aa  79.3  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  26.94 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  26.09 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  28.05 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1583  NMT1/THI5 like domain protein  27.76 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.11 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  30.89 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  30.25 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.13 
 
 
336 aa  77  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.15 
 
 
332 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 
915 aa  76.6  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  24.89 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.88 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  25.43 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  24.89 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.09 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.84 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  26.22 
 
 
775 aa  72.8  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  27.76 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  28.78 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  26.44 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  27.92 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  25.98 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  26.34 
 
 
856 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  23.66 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  27.05 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  25.76 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.03 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  27.5 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  27.09 
 
 
794 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.16 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.12 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0619  NMT1/THI5 like domain protein  25.4 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06841  nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  24.19 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>