More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2085 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  100 
 
 		 328 aa  657    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  40.6 
 
 		 338 aa  228  9e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.85 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.55 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.55 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.55 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  34.55 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  34.55 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.55 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.47 
 
 		 316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  36.47 
 
 		 316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  34.55 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  34.24 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  34.55 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.24 
 
 		 333 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  32.5 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  33.43 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  34.83 
 
 		 312 aa  192  7e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4256  NMT1/THI5 like domain protein  32.46 
 
 		 351 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.21 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.35 
 
 		 329 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  33.74 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  31.45 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.09 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.4 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  34 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  30.09 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  30.09 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  30.09 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  30.09 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.09 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  30.09 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.09 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.79 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.79 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.12 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  31.27 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.87 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  33.57 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.56 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  36.22 
 
 		 311 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  32.33 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  34.39 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1461  hypothetical protein  29.43 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  33.44 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  30.97 
 
 		 360 aa  159  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0477  NMT1/THI5 like domain protein  28.13 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  34.63 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06841  nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  32 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1522  hypothetical protein  29.1 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  29.94 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.68 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0392  NMT1/THI5 like domain protein  30.39 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  32.41 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  34.68 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  30.43 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  30.43 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13660  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  30.36 
 
 		 349 aa  143  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  26.06 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  32.02 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  27.91 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1669  NMT1/THI5 like domain protein  30 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.833326  normal  0.535701 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  26.89 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1887  NMT1/THI5 like domain protein  35.47 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50224  normal  0.0288593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  30.55 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.25 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  28.43 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.65 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  32.9 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  32.5 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  29.07 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  29.23 
 
 		 356 aa  109  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.75 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.6 
 
 		 1238 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3018  NMT1/THI5 like domain protein  29.02 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.37 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  29.43 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  26.47 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  30.06 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.49 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.73 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  28.9 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  26.88 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  28.19 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 915 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  33.33 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  29.84 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.66 
 
 		 348 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.75 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  30.25 
 
 		 336 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  24.17 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  30.07 
 
 		 593 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.98 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.8 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  27.67 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.79 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  26.87 
 
 		 348 aa  99.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0243  ABC transporter, permease protein, putative  24.05 
 
 		 587 aa  98.6  1e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.12 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4670  NMT1/THI5 like domain protein  24.28 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>