203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2699 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 
335 aa  678    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  64.65 
 
 
330 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  68.09 
 
 
329 aa  442  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  65.29 
 
 
330 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  66.34 
 
 
326 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  69.38 
 
 
328 aa  437  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140791  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  64.69 
 
 
326 aa  434  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  66.34 
 
 
326 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  63.24 
 
 
332 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  66.34 
 
 
326 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  60.18 
 
 
329 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  64.36 
 
 
329 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  63.79 
 
 
334 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  64.26 
 
 
334 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  55.96 
 
 
336 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  55.17 
 
 
323 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  56.77 
 
 
323 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  53.85 
 
 
336 aa  358  8e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4039  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  42.45 
 
 
343 aa  225  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  39.02 
 
 
378 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  36.95 
 
 
382 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  37.18 
 
 
385 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  35.79 
 
 
357 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  36.53 
 
 
359 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  34.67 
 
 
324 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  34.12 
 
 
361 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  36.36 
 
 
344 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1583  NMT1/THI5 like domain protein  35.21 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0856  hypothetical protein  33.77 
 
 
342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.028683  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1033  hypothetical protein  33.33 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152767  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  32.63 
 
 
674 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.43 
 
 
1075 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  30.45 
 
 
375 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.95 
 
 
323 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
915 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  31.2 
 
 
686 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  30.77 
 
 
778 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.25 
 
 
1238 aa  94.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  28.41 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  27.72 
 
 
354 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  25.47 
 
 
348 aa  89.4  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.16 
 
 
344 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  25.17 
 
 
1065 aa  87.8  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  29.8 
 
 
344 aa  86.7  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  30.14 
 
 
342 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  25.66 
 
 
364 aa  86.3  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  27.65 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  28.98 
 
 
593 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 
1004 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  26.01 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  26.01 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 
1004 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  25.99 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.05 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.37 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  25.77 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.53 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  25.27 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.37 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.94 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.88 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  26.4 
 
 
821 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.27 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.59 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  28.14 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  24.91 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  25.32 
 
 
856 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.76 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  27.38 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.87 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  27.69 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.57 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  25.96 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  24.68 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  24.48 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3018  NMT1/THI5 like domain protein  25.78 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  29.45 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  23.79 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  27.98 
 
 
775 aa  67.4  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  26.09 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  27.85 
 
 
721 aa  66.6  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  29.41 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.74 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3687  ABC transporter substrate-binding protein  27.31 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  25.68 
 
 
365 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  25.17 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1471  permease protein of ABC transporter  33.64 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  24.46 
 
 
311 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  28.46 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  25.27 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  25.61 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.63 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  26.17 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.33 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  25.36 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  25.36 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  26.92 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.22 
 
 
328 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>