210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1093 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
328 aa  668    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  92.99 
 
 
328 aa  633  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  92.68 
 
 
328 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  62.79 
 
 
343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  59.8 
 
 
314 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  54.13 
 
 
337 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  57.05 
 
 
342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  48.47 
 
 
328 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  46.41 
 
 
345 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  44.2 
 
 
336 aa  248  7e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  46.28 
 
 
346 aa  245  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  42.48 
 
 
339 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0799  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.67 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  42.24 
 
 
338 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  39.76 
 
 
352 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  41.06 
 
 
374 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  40.06 
 
 
329 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  41.2 
 
 
338 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0425  perplasmic binding protein of ABC transporter  39.63 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1471  permease protein of ABC transporter  42.09 
 
 
332 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1384  permease protein of ABC transporter  39.87 
 
 
333 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178302  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0331  perplasmic binding protein of ABC transporter  39.75 
 
 
344 aa  216  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.18125  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  41.31 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  37.83 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3687  ABC transporter substrate-binding protein  40.85 
 
 
351 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  38.72 
 
 
373 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  38.58 
 
 
344 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3143  perplasmic binding protein of ABC transporter  40.07 
 
 
351 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786011  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.74 
 
 
326 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  39.06 
 
 
322 aa  201  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5136  NMT1/THI5 like domain protein  40.92 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  39.06 
 
 
322 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  38.72 
 
 
322 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0570  ABC transporter periplasmic-binding protein  36.91 
 
 
339 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.3 
 
 
322 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  32.1 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  32.88 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.99 
 
 
1238 aa  102  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.21 
 
 
1075 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  29.3 
 
 
336 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  31.25 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  31.37 
 
 
329 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  28.62 
 
 
674 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  31.37 
 
 
323 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.46 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.95 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  26.77 
 
 
1065 aa  93.6  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.52 
 
 
330 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.22 
 
 
1004 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.3 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  31.09 
 
 
323 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  24.65 
 
 
721 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  25.57 
 
 
328 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 
1004 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.08 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  26.65 
 
 
336 aa  86.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.95 
 
 
344 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  22.11 
 
 
856 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  25.48 
 
 
686 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.84 
 
 
336 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.13 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  24.65 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  26.34 
 
 
893 aa  81.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  27.71 
 
 
778 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  29.07 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.77 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  29.41 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.17 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.35 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  26.05 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  26.05 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  26.05 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  26.05 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.05 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.05 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.05 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.62 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  29.39 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.87 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.05 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  29.39 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.53 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  23.53 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.75 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  29.36 
 
 
334 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  25.58 
 
 
340 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
915 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.24 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  29.24 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  26.28 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  24.92 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.17 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  25.53 
 
 
339 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  25.08 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.07 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.17 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  27.98 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.59 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  22.36 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>