198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0706 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  100 
 
 
345 aa  711    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  57.43 
 
 
338 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  56.44 
 
 
338 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  54.28 
 
 
339 aa  337  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  50.82 
 
 
329 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  49.34 
 
 
380 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  50.8 
 
 
352 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  49.67 
 
 
374 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  49.5 
 
 
373 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  51.16 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0331  perplasmic binding protein of ABC transporter  50.8 
 
 
344 aa  317  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.18125  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0425  perplasmic binding protein of ABC transporter  49.84 
 
 
341 aa  316  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  51.69 
 
 
343 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  46.15 
 
 
336 aa  306  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0570  ABC transporter periplasmic-binding protein  46.58 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  49.67 
 
 
346 aa  301  8.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  49.5 
 
 
328 aa  299  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0799  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.74 
 
 
336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3687  ABC transporter substrate-binding protein  47.39 
 
 
351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  47.99 
 
 
314 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3143  perplasmic binding protein of ABC transporter  46.38 
 
 
351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786011  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  46.13 
 
 
342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1384  permease protein of ABC transporter  45.51 
 
 
333 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178302  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  47.81 
 
 
328 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  47 
 
 
328 aa  278  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1471  permease protein of ABC transporter  43.83 
 
 
332 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5136  NMT1/THI5 like domain protein  46.38 
 
 
342 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  47.47 
 
 
328 aa  276  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.31 
 
 
337 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.81 
 
 
322 aa  269  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  43.81 
 
 
322 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  43.48 
 
 
322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.17 
 
 
326 aa  262  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  45.07 
 
 
336 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.44 
 
 
322 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  29.8 
 
 
364 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  29.54 
 
 
347 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  24.93 
 
 
375 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.44 
 
 
1075 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.35 
 
 
1238 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  25.17 
 
 
721 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  25.83 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.02 
 
 
344 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  25.39 
 
 
686 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  24.32 
 
 
593 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.73 
 
 
342 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  24.58 
 
 
794 aa  84  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  28.15 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 
915 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  24.32 
 
 
674 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.79 
 
 
1004 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.32 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  24.16 
 
 
1065 aa  79.3  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.11 
 
 
1004 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  27.6 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  27.94 
 
 
856 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  27.9 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  25.69 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  21.33 
 
 
330 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  28.11 
 
 
893 aa  75.1  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  24.56 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  25.9 
 
 
775 aa  74.3  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.43 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.32 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  23.21 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  23.76 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  26.52 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  26.05 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.85 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  23.41 
 
 
821 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  22.85 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  24.66 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  23.46 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  24.56 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  27.57 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.1 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  27.57 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.9 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  21.71 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.95 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.81 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.4 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.42 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  34.58 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  24.36 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3625  hypothetical protein  23.71 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  23.98 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  24.62 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  25.11 
 
 
357 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  23.83 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  23.83 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.24 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  31.82 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.59 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  27.8 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  21.59 
 
 
357 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  22.18 
 
 
344 aa  63.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.98 
 
 
347 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.09 
 
 
333 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>