More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1861 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
339 aa  688    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  90.56 
 
 
336 aa  606  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  33.2 
 
 
346 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 
340 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.64 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.73 
 
 
344 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.17 
 
 
331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.19 
 
 
336 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  29.8 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.63 
 
 
345 aa  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  31.14 
 
 
348 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  31.86 
 
 
354 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.11 
 
 
351 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  30.25 
 
 
328 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  28.12 
 
 
349 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.12 
 
 
336 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  27.43 
 
 
674 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  25.58 
 
 
344 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  26.02 
 
 
375 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  26.69 
 
 
335 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3969  NMT1/THI5 like domain protein  26.27 
 
 
346 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  28.4 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  26.27 
 
 
335 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
915 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  24.47 
 
 
338 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.24 
 
 
351 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  24.63 
 
 
352 aa  96.3  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  24.3 
 
 
339 aa  95.9  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  28.12 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.25 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1461  hypothetical protein  27.5 
 
 
314 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1522  hypothetical protein  27.5 
 
 
314 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.95 
 
 
362 aa  93.6  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1084  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  25.74 
 
 
340 aa  93.2  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1941  NMT1/THI5 family protein  26.25 
 
 
337 aa  92.8  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000780337 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  30.77 
 
 
321 aa  92.4  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  27.84 
 
 
342 aa  90.9  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  26.12 
 
 
686 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  25.93 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  25.41 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.5 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  26.2 
 
 
353 aa  87  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  26.73 
 
 
325 aa  86.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
355 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0666  NMT1/THI5 like domain protein  26.07 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  27.59 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.64 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.87 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.97 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2680  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  26.57 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.01 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  27.68 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.74 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  23.75 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  25.53 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.63 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.76 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  24.63 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  23.85 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.63 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.69 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  25.6 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.71 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  25.1 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  25.09 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.45 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  24.63 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.37 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  24.63 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.26 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  24.26 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6053  NMT1/THI5 like domain protein  26.1 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.8 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.37 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  27.8 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  27.39 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.56 
 
 
1075 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.26 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  23.98 
 
 
856 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3417  NMT1/THI5 like domain protein  25.23 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.01 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  26.01 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  26.01 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  26.01 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.89 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  24.73 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  26.01 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.14 
 
 
1238 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  24.22 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.73 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.01 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  24.62 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.71 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1669  NMT1/THI5 like domain protein  24.33 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.833326  normal  0.535701 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  24.92 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  26.25 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.52 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>