175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0955 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  693    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  63.58 
 
 		 353 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2680  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  63.34 
 
 		 353 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  39.94 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  39.2 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  37.62 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  37.3 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1941  NMT1/THI5 family protein  36.45 
 
 		 337 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000780337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.22 
 
 		 362 aa  180  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  35.9 
 
 		 339 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  32.68 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.34 
 
 		 345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.23 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  30.21 
 
 		 352 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  32.14 
 
 		 344 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3969  NMT1/THI5 like domain protein  31.61 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  31.46 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.94 
 
 		 351 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1084  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  29.08 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  29.55 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  28.57 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.92 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.13 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  25.8 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  29.17 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.78 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  25.98 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  26.21 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  23.05 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 915 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.88 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  22.29 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  26.67 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.62 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  26.14 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  26.09 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1461  hypothetical protein  26.05 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1522  hypothetical protein  26.05 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  26.33 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  25.3 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  25.71 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.75 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  25.52 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  27.57 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.81 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  22.52 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  27.31 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  24.89 
 
 		 686 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  24.62 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  25.09 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.37 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0856  hypothetical protein  26 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.028683  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  23.81 
 
 		 674 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.91 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  22.01 
 
 		 794 aa  60.5  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.68 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.05 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  21.93 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  27.45 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  27.45 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.22 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.27 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  24.05 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0243  ABC transporter, permease protein, putative  24.8 
 
 		 587 aa  59.3  0.00000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.05 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6053  NMT1/THI5 like domain protein  26.99 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.57 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  24.05 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  23.73 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  24.05 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  24.51 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  23.36 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.54 
 
 		 1075 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0666  NMT1/THI5 like domain protein  22.82 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  24.02 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1033  hypothetical protein  25.2 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152767  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  25.08 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.75 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.95 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  22.29 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  23.81 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  23.92 
 
 		 778 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.38 
 
 		 1238 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  25.51 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1134  NMT1/THI5 like domain protein  26.43 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0477  NMT1/THI5 like domain protein  22.01 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  30.72 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2277  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.06 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191617  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.92 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.41 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2402  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  23.25 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.150141  normal  0.561383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.68 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.32 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  23.48 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  22.07 
 
 		 322 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  24.01 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.35 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  24.9 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>