More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3032 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
348 aa  712    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  61.74 
 
 
354 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.96 
 
 
323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
365 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  30.88 
 
 
335 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  31.46 
 
 
357 aa  133  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
915 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  33.33 
 
 
686 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  29.15 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 
331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.22 
 
 
1075 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.06 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.92 
 
 
1238 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5692  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.35 
 
 
360 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  27.51 
 
 
856 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  31.73 
 
 
778 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  32.64 
 
 
381 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  29.18 
 
 
375 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
1004 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  30.15 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1302  NMT1/THI5 like domain protein  29.61 
 
 
364 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0447941  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
1004 aa  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  30.52 
 
 
593 aa  112  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.24 
 
 
344 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  27.99 
 
 
360 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  28.53 
 
 
330 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.65 
 
 
342 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  27.63 
 
 
674 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.47 
 
 
345 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  31.14 
 
 
339 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  30.4 
 
 
336 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  26.56 
 
 
1065 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  28.08 
 
 
893 aa  100  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  28.4 
 
 
328 aa  99.4  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  26.87 
 
 
328 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  29.2 
 
 
344 aa  97.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  27.45 
 
 
775 aa  95.9  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  28.17 
 
 
323 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.22 
 
 
329 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  30.29 
 
 
316 aa  94.4  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  26.83 
 
 
364 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.29 
 
 
316 aa  94.4  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  28.94 
 
 
323 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.47 
 
 
335 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  28.23 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.38 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.62 
 
 
332 aa  90.1  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.69 
 
 
332 aa  89.4  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  29.29 
 
 
334 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  24.85 
 
 
340 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  27.75 
 
 
721 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  24.69 
 
 
821 aa  88.6  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  25.55 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  24.81 
 
 
794 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.79 
 
 
341 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  27.69 
 
 
326 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  29.06 
 
 
334 aa  87  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  25.1 
 
 
339 aa  87  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.69 
 
 
336 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  27.17 
 
 
339 aa  86.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.56 
 
 
346 aa  86.3  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0799  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.2 
 
 
336 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.94 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.94 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  25.56 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  25.56 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  25.56 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  26.02 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.54 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.56 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  25.56 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.56 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.11 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  26.78 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  26.03 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  25.4 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  24.91 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.56 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  27.47 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.27 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  25.42 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  26.67 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  24.13 
 
 
385 aa  82.8  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.69 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.67 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  24.75 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.09 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.38 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  25 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  26.32 
 
 
338 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  25 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  26.38 
 
 
360 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  25 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.03 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  26.03 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  26.72 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  26.25 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.03 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.49 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>