153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1136 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  100 
 
 
351 aa  701    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3969  NMT1/THI5 like domain protein  67.55 
 
 
346 aa  454  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1084  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  63.61 
 
 
340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  39.76 
 
 
345 aa  209  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  38.66 
 
 
344 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  36.98 
 
 
352 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  37.85 
 
 
346 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.94 
 
 
362 aa  202  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  38.01 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.94 
 
 
335 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  35.28 
 
 
335 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  34.95 
 
 
335 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  33.01 
 
 
339 aa  172  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.18 
 
 
336 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1941  NMT1/THI5 family protein  34.82 
 
 
337 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000780337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  32.29 
 
 
349 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.63 
 
 
351 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  31.51 
 
 
353 aa  139  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2680  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  31.45 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.34 
 
 
331 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  26.89 
 
 
329 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  29.11 
 
 
339 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  26.89 
 
 
338 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.79 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  23.15 
 
 
355 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  24.57 
 
 
332 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.95 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
915 aa  79.7  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.13 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  23.58 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  26.75 
 
 
593 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.38 
 
 
346 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.04 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  26.18 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  25.4 
 
 
674 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  22.36 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  28.52 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  24.05 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  26.07 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  27.2 
 
 
686 aa  66.6  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  25.75 
 
 
322 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.65 
 
 
344 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.32 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  26.39 
 
 
375 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  25.51 
 
 
327 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.36 
 
 
342 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.94 
 
 
328 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  25.73 
 
 
342 aa  63.5  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  27.16 
 
 
349 aa  63.2  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  25.81 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  25.4 
 
 
385 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.01 
 
 
345 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
357 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.73 
 
 
1238 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.75 
 
 
323 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.77 
 
 
1075 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  25.96 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.67 
 
 
326 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.96 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  23.17 
 
 
333 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  26.2 
 
 
378 aa  60.1  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  27.35 
 
 
335 aa  60.1  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.13 
 
 
336 aa  59.3  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  22.31 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.09 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  20.28 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  23.87 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.86 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  23.51 
 
 
893 aa  57.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  27.78 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  25.33 
 
 
325 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  26.84 
 
 
348 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  26.18 
 
 
775 aa  57  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  23.67 
 
 
360 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  25.32 
 
 
328 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.65 
 
 
347 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  26.07 
 
 
323 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  27.08 
 
 
344 aa  56.2  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  25.6 
 
 
323 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  26.04 
 
 
344 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5692  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.64 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.67 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  24.92 
 
 
321 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  20.54 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  24.15 
 
 
778 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  27.27 
 
 
344 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  22.76 
 
 
342 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  25.81 
 
 
323 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  30.36 
 
 
361 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  24.79 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  26.51 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.31 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  23.79 
 
 
338 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  23.49 
 
 
365 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  26.33 
 
 
335 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  25.56 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  27.08 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  26.62 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  21.83 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>