192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1097 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  100 
 
 
362 aa  727    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  70.67 
 
 
352 aa  481  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  71.64 
 
 
344 aa  482  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  72.59 
 
 
346 aa  475  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  69.06 
 
 
341 aa  472  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  72.44 
 
 
345 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  49.21 
 
 
339 aa  287  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  44.44 
 
 
335 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  43.18 
 
 
335 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  42.86 
 
 
335 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  42.3 
 
 
336 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1941  NMT1/THI5 family protein  41.67 
 
 
337 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000780337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.94 
 
 
351 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.44 
 
 
351 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3969  NMT1/THI5 like domain protein  37.38 
 
 
346 aa  195  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1084  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  34.11 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2680  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  34.92 
 
 
353 aa  178  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  33.75 
 
 
353 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  34.22 
 
 
349 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.65 
 
 
331 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  32.13 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  27.67 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.33 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  31.36 
 
 
338 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  29 
 
 
340 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.11 
 
 
344 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  25.08 
 
 
333 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.1 
 
 
342 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.11 
 
 
345 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  25.95 
 
 
339 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.43 
 
 
341 aa  92.8  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  24.84 
 
 
323 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  26.34 
 
 
336 aa  89.7  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.52 
 
 
339 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.3 
 
 
1075 aa  86.3  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  28.34 
 
 
674 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  27.85 
 
 
593 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  23.85 
 
 
686 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  25.08 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  24.84 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  25 
 
 
778 aa  83.2  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  28.42 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.64 
 
 
1238 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  24.81 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  27.52 
 
 
328 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.95 
 
 
915 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  26.84 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  24.05 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  26.56 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.28 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.98 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  24.17 
 
 
775 aa  65.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  25.96 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.31 
 
 
348 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6053  NMT1/THI5 like domain protein  24.21 
 
 
323 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  26.12 
 
 
365 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  25.28 
 
 
381 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.12 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  25.45 
 
 
326 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  24.73 
 
 
326 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  22.53 
 
 
327 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.21 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  25.94 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.89 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.13 
 
 
1004 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  28.39 
 
 
341 aa  60.1  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  23.89 
 
 
340 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  22.86 
 
 
364 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  24.48 
 
 
325 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.56 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0257  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.69 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.953427  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3417  NMT1/THI5 like domain protein  37.78 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.56 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.71 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  23.56 
 
 
333 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.27 
 
 
1004 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.56 
 
 
333 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  25.77 
 
 
333 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4513  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.29 
 
 
335 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.83 
 
 
347 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  22.6 
 
 
348 aa  56.6  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  20.09 
 
 
357 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.56 
 
 
333 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.77 
 
 
333 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0233  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.32 
 
 
323 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.786536  decreased coverage  0.000160369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  25.94 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  25.94 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  23.37 
 
 
856 aa  55.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  26.36 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0248  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.32 
 
 
323 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0698542  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  23.51 
 
 
721 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  23.41 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  24.45 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  25.17 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  26.79 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.57 
 
 
329 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.84 
 
 
336 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  24.1 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>