190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5692 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5692  NMT1/THI5-like domain-containing protein  100 
 
 
360 aa  724    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  48.15 
 
 
365 aa  321  9.000000000000001e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1302  NMT1/THI5 like domain protein  49.2 
 
 
364 aa  296  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0447941  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  46.48 
 
 
357 aa  267  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  37.92 
 
 
331 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.91 
 
 
331 aa  204  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  38.72 
 
 
335 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  34.67 
 
 
331 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.34 
 
 
323 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  30.15 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  31.48 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  26.79 
 
 
375 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  28.57 
 
 
330 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  29.73 
 
 
344 aa  95.9  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  26.16 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  28.98 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  29.17 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  27.92 
 
 
686 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  25.41 
 
 
674 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
915 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.76 
 
 
1075 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  28.39 
 
 
338 aa  86.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.08 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  28.14 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  28.62 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  26.25 
 
 
778 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.56 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  28.57 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.79 
 
 
1004 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.42 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.22 
 
 
1004 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  28.78 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.1 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  25.09 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  28.78 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  28.81 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.4 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  25 
 
 
593 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  26.73 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  23.76 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.24 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  25.47 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  24.42 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  25.47 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.24 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  27.04 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.43 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.05 
 
 
333 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.8 
 
 
335 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  29.05 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.05 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  29.05 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  23.94 
 
 
856 aa  66.6  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  29.05 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.05 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.75 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  29.05 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  29.05 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  21.94 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25.69 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  24.45 
 
 
721 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  24.05 
 
 
374 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  27.96 
 
 
311 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.08 
 
 
1238 aa  64.7  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 
332 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  21.51 
 
 
345 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  26.91 
 
 
349 aa  63.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.32 
 
 
332 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.75 
 
 
332 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.67 
 
 
332 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0570  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.78 
 
 
339 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  21.96 
 
 
1065 aa  62.8  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25 
 
 
332 aa  62.8  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  25.31 
 
 
323 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6053  NMT1/THI5 like domain protein  29.63 
 
 
323 aa  62.8  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  23.38 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  18.05 
 
 
775 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23 
 
 
322 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  22.62 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  26.18 
 
 
893 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.47 
 
 
336 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  24.26 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  22.84 
 
 
373 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  24.26 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.05 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.1 
 
 
322 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  23.79 
 
 
346 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.21 
 
 
336 aa  60.1  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  26.15 
 
 
344 aa  59.7  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  24.17 
 
 
347 aa  59.7  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.05 
 
 
336 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>