272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3755 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  100 
 
 
335 aa  669    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  57.28 
 
 
335 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  56.31 
 
 
335 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  56.81 
 
 
336 aa  362  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1941  NMT1/THI5 family protein  52.26 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000780337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  40.88 
 
 
353 aa  269  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.32 
 
 
362 aa  268  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  43.35 
 
 
339 aa  259  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2680  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  40.57 
 
 
353 aa  255  6e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  42.81 
 
 
352 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  44.66 
 
 
346 aa  255  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  42.94 
 
 
344 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  39.94 
 
 
349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.37 
 
 
345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  40.25 
 
 
341 aa  235  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.56 
 
 
351 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.65 
 
 
351 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3969  NMT1/THI5 like domain protein  35.78 
 
 
346 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1084  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  34.09 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  30.45 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  28.9 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  27.97 
 
 
346 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  31.51 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.32 
 
 
331 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  27.84 
 
 
339 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  28.12 
 
 
328 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  30.42 
 
 
674 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.83 
 
 
336 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.17 
 
 
344 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.08 
 
 
336 aa  93.2  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  27.46 
 
 
360 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
323 aa  90.1  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  29.18 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  27.48 
 
 
778 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.57 
 
 
333 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.62 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.06 
 
 
341 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  25.96 
 
 
333 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.57 
 
 
333 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.47 
 
 
333 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  25.45 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  32.33 
 
 
339 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  27.54 
 
 
686 aa  88.6  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  26.52 
 
 
375 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  28.21 
 
 
333 aa  87  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  27.07 
 
 
381 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.08 
 
 
1238 aa  87  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.21 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.21 
 
 
333 aa  85.9  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.32 
 
 
323 aa  85.9  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  28.21 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  27.84 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  28.21 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.15 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.73 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
915 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  25.62 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  26.25 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  24.85 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.44 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.21 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.93 
 
 
1075 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  25.68 
 
 
335 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  27.1 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  26.32 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  26.21 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  27.14 
 
 
330 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  26.21 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  25.61 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.38 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.8 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  26.13 
 
 
365 aa  75.9  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.16 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.34 
 
 
1004 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  23.38 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0666  NMT1/THI5 like domain protein  26.61 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.88 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  29.49 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  26.73 
 
 
593 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4256  NMT1/THI5 like domain protein  26.19 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  28.4 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.75 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  24.69 
 
 
821 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.46 
 
 
1004 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  28.21 
 
 
343 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  28.16 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  26.82 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  25.91 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.02 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140791  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.2 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  26.77 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  25.4 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  26 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  24.88 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  24.82 
 
 
775 aa  69.3  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  25.88 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5692  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.8 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  26.69 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  24.55 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  24.5 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>