174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1162 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 		 344 aa  697    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  69.26 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  57.7 
 
 		 329 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  60.7 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  59.55 
 
 		 380 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  59.22 
 
 		 373 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0331  perplasmic binding protein of ABC transporter  59.49 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.18125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0425  perplasmic binding protein of ABC transporter  56.19 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0570  ABC transporter periplasmic-binding protein  56.1 
 
 		 339 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  54.14 
 
 		 339 aa  358  7e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3687  ABC transporter substrate-binding protein  54.46 
 
 		 351 aa  353  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3143  perplasmic binding protein of ABC transporter  54.22 
 
 		 351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786011  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  52.29 
 
 		 338 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5136  NMT1/THI5 like domain protein  53.57 
 
 		 342 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  51.95 
 
 		 338 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1384  permease protein of ABC transporter  48.2 
 
 		 333 aa  333  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  51.16 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  48.78 
 
 		 336 aa  305  8.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1471  permease protein of ABC transporter  47.17 
 
 		 332 aa  299  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  49.68 
 
 		 346 aa  298  6e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  42.6 
 
 		 336 aa  262  6e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  42.28 
 
 		 326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  41 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0799  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.04 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.42 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  43.09 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  41.33 
 
 		 322 aa  232  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  40.6 
 
 		 322 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  40.67 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  39.42 
 
 		 314 aa  219  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  39.45 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  38.94 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  37.65 
 
 		 328 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.28 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.68 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  32.1 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  31.62 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  31.08 
 
 		 375 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 		 1004 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 915 aa  96.3  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  25.96 
 
 		 856 aa  92.8  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  25.81 
 
 		 1065 aa  91.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 		 1004 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.88 
 
 		 344 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  27.39 
 
 		 794 aa  89  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  27.06 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.96 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.41 
 
 		 1075 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.33 
 
 		 1238 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.86 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  25.94 
 
 		 674 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  26.87 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  26.42 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  26.22 
 
 		 775 aa  74.3  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  22.92 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  24.69 
 
 		 893 aa  72.8  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.14 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  25 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.42 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.04 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  24.36 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  26.88 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3625  hypothetical protein  24.05 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.51 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.83 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  26.82 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  25.48 
 
 		 721 aa  69.3  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  25.91 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.82 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  25.31 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.31 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  24.51 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  24.83 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  25.45 
 
 		 593 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  25.32 
 
 		 686 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  24.17 
 
 		 778 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0260  hypothetical protein  29.32 
 
 		 392 aa  67  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17290  hypothetical protein  26.7 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.047766  normal  0.203711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  25.32 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  25.52 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.32 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  24.88 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  24.63 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  26.67 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  26.05 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  23.53 
 
 		 821 aa  63.5  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  26.5 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  27.44 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  26.89 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.16 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.48 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.32 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  22.6 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  23.67 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  25.08 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  22.48 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  24.89 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  27.16 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>