More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3655 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 311 aa  635    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  74.84 
 
 		 311 aa  481  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  66.21 
 
 		 323 aa  435  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  62.54 
 
 		 322 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  64.12 
 
 		 322 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  64.12 
 
 		 322 aa  420  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  59.66 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  59.66 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  58.28 
 
 		 309 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  55.7 
 
 		 335 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  55.7 
 
 		 311 aa  362  3e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  54.11 
 
 		 329 aa  361  8e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06841  nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  52 
 
 		 337 aa  325  9e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  51.67 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  51.17 
 
 		 315 aa  322  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  50.84 
 
 		 312 aa  320  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  48.12 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1887  NMT1/THI5 like domain protein  45.08 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50224  normal  0.0288593 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  40.07 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.11 
 
 		 333 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.45 
 
 		 333 aa  162  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  31.11 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.35 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.43 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  31.02 
 
 		 333 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.48 
 
 		 333 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.69 
 
 		 333 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  30.69 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  30.36 
 
 		 333 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  30.36 
 
 		 333 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  32.41 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  32.04 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  25.93 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1461  hypothetical protein  24.91 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1522  hypothetical protein  24.19 
 
 		 314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.62 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  25 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2330  thiamine biosynthesis protein, putative  27.3 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  26.94 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.94 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0477  NMT1/THI5 like domain protein  26.3 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  29.07 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.91 
 
 		 332 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.05 
 
 		 332 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  26.05 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  23.73 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  23.73 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  23.73 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.73 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.73 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  23.73 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.73 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.05 
 
 		 332 aa  99.4  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.32 
 
 		 332 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  24.25 
 
 		 342 aa  90.5  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.21 
 
 		 331 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4256  NMT1/THI5 like domain protein  24.79 
 
 		 351 aa  89.4  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  27.67 
 
 		 336 aa  89  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  25.37 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.87 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33535  predicted protein  25.43 
 
 		 357 aa  87  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  24.11 
 
 		 327 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.27 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  26.63 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0243  ABC transporter, permease protein, putative  25.47 
 
 		 587 aa  84.7  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  27.08 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  28.33 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  24.69 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  28.29 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  26.02 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.69 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  24.69 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.18 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.68 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.77 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.51 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  27.52 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  24.56 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  26.26 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  26.74 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  26.89 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  28.44 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  27.9 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  26.21 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.72 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  27.15 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3147  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.86 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  25.75 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  25.19 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  28.63 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  26.29 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  27.06 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  25.32 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.61 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  27.63 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  25.53 
 
 		 593 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0392  NMT1/THI5 like domain protein  22.79 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  28.11 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  25.93 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.64 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>