More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0243 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0243  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 587 aa  1192    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  32.03 
 
 		 265 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 		 253 aa  135  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  30 
 
 		 266 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 		 257 aa  133  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  30.3 
 
 		 257 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  30.3 
 
 		 257 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 		 255 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  30.93 
 
 		 265 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0488  putative binding protein-dependent transport system, membrane component  32.47 
 
 		 272 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.970837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  30.93 
 
 		 265 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 		 255 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  30.14 
 
 		 266 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  30.93 
 
 		 257 aa  132  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  30.93 
 
 		 257 aa  132  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 		 250 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 		 222 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  30.51 
 
 		 265 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 		 256 aa  127  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 		 254 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 		 259 aa  124  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 273 aa  123  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 		 250 aa  123  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 		 257 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 		 274 aa  121  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 		 268 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 		 278 aa  120  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.03 
 
 		 261 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.87 
 
 		 260 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 		 273 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 		 281 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 		 258 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  28.47 
 
 		 312 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 		 263 aa  114  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.63 
 
 		 284 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  29.31 
 
 		 251 aa  113  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.75 
 
 		 246 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.29 
 
 		 255 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 		 272 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.025765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0644  ABC transporter, inner membrane subunit  37.67 
 
 		 238 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 		 249 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.04587  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 		 238 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0792355  normal  0.132671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 		 282 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 		 238 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.98825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 		 255 aa  110  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 		 257 aa  110  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 		 247 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 		 282 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 		 283 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 		 288 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.173855  normal  0.365472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 		 272 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 		 258 aa  108  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.34 
 
 		 265 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 		 272 aa  107  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.69 
 
 		 249 aa  106  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1076  ABC transporter-like protein  29.82 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.276573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.9 
 
 		 258 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  31.17 
 
 		 251 aa  104  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  31.17 
 
 		 250 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 		 268 aa  103  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  28.18 
 
 		 249 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  30.74 
 
 		 250 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  30.74 
 
 		 250 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  30.74 
 
 		 251 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0211  ABC transporter, permease protein  29.5 
 
 		 258 aa  101  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  30.74 
 
 		 250 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  30.74 
 
 		 250 aa  101  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  30.74 
 
 		 250 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.85 
 
 		 254 aa  101  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112586  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 		 288 aa  101  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 		 251 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 		 277 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.79 
 
 		 254 aa  100  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0202  ABC transporter, permease protein  29.5 
 
 		 258 aa  100  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  30.97 
 
 		 250 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.23 
 
 		 259 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  29.63 
 
 		 282 aa  100  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.08 
 
 		 268 aa  100  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  27.27 
 
 		 338 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.02 
 
 		 243 aa  99  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  30.09 
 
 		 247 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 		 253 aa  98.2  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  26.4 
 
 		 329 aa  98.2  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  23.25 
 
 		 323 aa  98.2  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.43 
 
 		 255 aa  97.8  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.09 
 
 		 322 aa  97.4  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  25.28 
 
 		 311 aa  97.1  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 		 275 aa  97.1  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.05 
 
 		 257 aa  97.1  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  24.26 
 
 		 328 aa  97.1  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.19 
 
 		 282 aa  97.1  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0528385  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.84 
 
 		 250 aa  96.3  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  23.63 
 
 		 315 aa  96.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0111  ABC transporter related  33.12 
 
 		 493 aa  96.3  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 		 271 aa  96.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 		 255 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 		 274 aa  96.3  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000362296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.5 
 
 		 256 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 		 259 aa  95.1  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 		 258 aa  95.5  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0347556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>