More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2297 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 		 312 aa  640    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  46.52 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  41.99 
 
 		 323 aa  229  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  40.07 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  39.66 
 
 		 311 aa  215  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.84 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  40.21 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.63 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  37.85 
 
 		 335 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.41 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06841  nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  37.58 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  37.25 
 
 		 316 aa  198  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  37.83 
 
 		 312 aa  198  9e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  37.5 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  34.83 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  37.82 
 
 		 311 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  37.82 
 
 		 311 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.09 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  37.37 
 
 		 338 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  35.97 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.89 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.89 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.4 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  31.58 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  31.58 
 
 		 333 aa  178  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.63 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  31.63 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  31.31 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  31.31 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.49 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.98 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  32.51 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  30.77 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1887  NMT1/THI5 like domain protein  33.22 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50224  normal  0.0288593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  30.21 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1522  hypothetical protein  28.38 
 
 		 314 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1461  hypothetical protein  28.38 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  28.3 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.45 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.97 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  27.97 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  28.27 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  27.84 
 
 		 342 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.03 
 
 		 329 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.5 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1669  NMT1/THI5 like domain protein  30.93 
 
 		 360 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.833326  normal  0.535701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  29.39 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4256  NMT1/THI5 like domain protein  29.51 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  27.59 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.13 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.13 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  30.47 
 
 		 360 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  29.71 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  29.71 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  29.71 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.71 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  29.71 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.71 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0243  ABC transporter, permease protein, putative  28.9 
 
 		 587 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  26.5 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  26.71 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2330  thiamine biosynthesis protein, putative  24.04 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0477  NMT1/THI5 like domain protein  23.79 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3018  NMT1/THI5 like domain protein  30.43 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.53 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  29.15 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0392  NMT1/THI5 like domain protein  24.4 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  28.96 
 
 		 686 aa  96.3  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33535  predicted protein  28.43 
 
 		 357 aa  96.3  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1941  NMT1/THI5 like domain protein  26.12 
 
 		 315 aa  95.9  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.876036  hitchhiker  0.000270678 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  27.57 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  28.99 
 
 		 350 aa  93.6  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  28.25 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  25.6 
 
 		 593 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4670  NMT1/THI5 like domain protein  26.43 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  27.41 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  23.81 
 
 		 360 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.15 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.75 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  30 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.44 
 
 		 1075 aa  87  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  28.25 
 
 		 349 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 915 aa  85.9  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  26.72 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  26.81 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  26.73 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.09 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  25.28 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  26.69 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  28.29 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13660  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  24.53 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.35 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.17 
 
 		 1238 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  26.59 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  25.98 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  26.73 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  27.55 
 
 		 721 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  25.58 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  25.68 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>