More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0488 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0488  putative binding protein-dependent transport system, membrane component  100 
 
 
272 aa  536  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.970837  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  76.01 
 
 
266 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  74.35 
 
 
266 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  76.64 
 
 
265 aa  391  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.87 
 
 
255 aa  272  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.18 
 
 
249 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.04587  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.65 
 
 
253 aa  232  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.01 
 
 
255 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1643  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.86 
 
 
261 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0353041  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.28 
 
 
245 aa  218  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0211  ABC transporter, permease protein  45.16 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.16 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0202  ABC transporter, permease protein  44.62 
 
 
258 aa  211  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0906  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.5 
 
 
244 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53091  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.64 
 
 
238 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.98825  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.61 
 
 
243 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0644  ABC transporter, inner membrane subunit  52.47 
 
 
238 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.47 
 
 
238 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0792355  normal  0.132671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.06 
 
 
250 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
257 aa  171  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
257 aa  165  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
254 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  36.32 
 
 
249 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
249 aa  160  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  32.55 
 
 
265 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 
257 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 
257 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  32.67 
 
 
265 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  32.67 
 
 
265 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  32.67 
 
 
257 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  32.67 
 
 
257 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
255 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  32.67 
 
 
257 aa  158  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 
255 aa  158  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.43 
 
 
284 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
281 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
258 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.34 
 
 
277 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
250 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
259 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
271 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
256 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 
246 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
299 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  33.86 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
254 aa  145  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112586  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.4 
 
 
261 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.89 
 
 
260 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  33.86 
 
 
251 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
275 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
250 aa  142  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
266 aa  142  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  36.7 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  36.7 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  36.7 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  36.7 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  36.7 
 
 
250 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
222 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  35.78 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  35.78 
 
 
250 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  34.69 
 
 
251 aa  138  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
253 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
268 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
273 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
256 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783663  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
247 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  33.48 
 
 
282 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549296  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.173855  normal  0.365472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
263 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  33.61 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  35.65 
 
 
247 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.56 
 
 
254 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169849 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
272 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.025765  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.97 
 
 
256 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
258 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0243  ABC transporter, permease protein, putative  33.82 
 
 
587 aa  124  1e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
259 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
282 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0528385  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
253 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.946292  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02100  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  32.78 
 
 
308 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 
258 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0347556  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0111  ABC transporter related  38.21 
 
 
493 aa  123  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
282 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>