More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06840 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  100 
 
 		 266 aa  532  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  96.62 
 
 		 266 aa  519  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  76.89 
 
 		 265 aa  418  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0488  putative binding protein-dependent transport system, membrane component  74.35 
 
 		 272 aa  384  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.970837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.08 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.53 
 
 		 249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.04587  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.17 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1643  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.25 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0353041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.04 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 245 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0211  ABC transporter, permease protein  46.64 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0202  ABC transporter, permease protein  46.64 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.65 
 
 		 258 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.83 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.58 
 
 		 238 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.98825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0906  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.22 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0644  ABC transporter, inner membrane subunit  50.45 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.45 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0792355  normal  0.132671 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.37 
 
 		 250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 		 249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  36.6 
 
 		 249 aa  165  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 		 275 aa  162  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.31 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  32.8 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  32.8 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  33.77 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  33.77 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  33.77 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  33.77 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 		 275 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.8 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 		 299 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 		 251 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  35.66 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  35.51 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.68 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  35.66 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  35.25 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  35.25 
 
 		 250 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  35.25 
 
 		 250 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  35.25 
 
 		 250 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  35.25 
 
 		 250 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 		 251 aa  141  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566245  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  32.61 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  32.82 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.805205  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.173855  normal  0.365472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1076  ABC transporter-like protein  37.84 
 
 		 488 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.276573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 		 263 aa  131  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  30.89 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.52 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.946292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  33.77 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2545  binding-protein-dependent transport system protein  29.23 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240068  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 		 268 aa  125  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0528385  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 		 280 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.025765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0111  ABC transporter related  38.61 
 
 		 493 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>