More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3871 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
280 aa  554  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208081  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.74 
 
 
294 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.89 
 
 
298 aa  314  8e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.433007  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3414  ATP-binding protein of ABC transporter  67.46 
 
 
280 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.24 
 
 
283 aa  301  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0801  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  55.38 
 
 
298 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745387  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.93 
 
 
268 aa  281  8.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.08 
 
 
285 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0792607  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.56 
 
 
287 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00381914  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3552  ABC transporter membrane spanning protein  55.6 
 
 
285 aa  261  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.47 
 
 
264 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.71 
 
 
267 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318809  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.17 
 
 
284 aa  258  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.65192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.47 
 
 
264 aa  258  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.74 
 
 
264 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0240883  normal  0.166534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.79 
 
 
285 aa  256  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13305  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1263  ABC transporter permease  50 
 
 
262 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.3 
 
 
278 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.74 
 
 
279 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.17 
 
 
267 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3210  ABC transporter, permease protein  51.36 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2015  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  47.62 
 
 
252 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.52 
 
 
274 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0258  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.12 
 
 
274 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7480  ABC transporter permease  54.81 
 
 
271 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.131238 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.43 
 
 
274 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0627389  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.65 
 
 
260 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.4 
 
 
276 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.05 
 
 
262 aa  201  9e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.86 
 
 
254 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.404323  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
277 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
277 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.81 
 
 
275 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.67 
 
 
252 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21476  normal  0.0147088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695693  normal  0.331928 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0255815  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
281 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
273 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  30 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
258 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  30 
 
 
266 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
254 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
257 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.38 
 
 
259 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02100  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30.53 
 
 
308 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
289 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17280  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  32.26 
 
 
325 aa  118  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158115  normal  0.544115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000896674  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3460  ABC transporter membrane spanning protein  33.84 
 
 
288 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
305 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856164  normal  0.860518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
288 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752734  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  28.09 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.39 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.13 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32312  normal  0.0411868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
453 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
272 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.025765  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  31.5 
 
 
249 aa  112  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
253 aa  112  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0111  ABC transporter related  35.48 
 
 
493 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1076  ABC transporter-like protein  34.55 
 
 
488 aa  109  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  32.88 
 
 
282 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
282 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2545  binding-protein-dependent transport system protein  28.12 
 
 
287 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240068  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
256 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
258 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121812  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.48 
 
 
260 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.4 
 
 
258 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.13 
 
 
281 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58323  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0817  ABC transporter related protein  31.46 
 
 
492 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
246 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
275 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
250 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
282 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
322 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.167871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
272 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.69 
 
 
284 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.06 
 
 
282 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0528385  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
247 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
303 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.674946  normal  0.833857 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
254 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  30.77 
 
 
251 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0488  putative binding protein-dependent transport system, membrane component  28.63 
 
 
272 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.970837  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  31.17 
 
 
247 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
255 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.55 
 
 
256 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.31 
 
 
255 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
271 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
250 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0247808  normal  0.0244453 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1495  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
305 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>