More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0817 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1076  ABC transporter-like protein  77.14 
 
 
488 aa  700    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0817  ABC transporter related protein  100 
 
 
492 aa  971    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0111  ABC transporter related  52.8 
 
 
493 aa  400  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  46.93 
 
 
259 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  51.6 
 
 
253 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  51.31 
 
 
252 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  47.95 
 
 
258 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  48.53 
 
 
263 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.3 
 
 
271 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  49.01 
 
 
254 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
278 aa  173  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  52.55 
 
 
272 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  46.3 
 
 
271 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  49.75 
 
 
253 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  48.99 
 
 
260 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  49.49 
 
 
263 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.5 
 
 
252 aa  171  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  50.25 
 
 
266 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.9 
 
 
260 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  47.26 
 
 
261 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.51 
 
 
280 aa  170  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  50.54 
 
 
276 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.69 
 
 
271 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  51.01 
 
 
272 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  44.89 
 
 
266 aa  170  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.74 
 
 
251 aa  170  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  46.08 
 
 
258 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  46.58 
 
 
257 aa  169  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.99 
 
 
288 aa  169  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.59 
 
 
264 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  45.23 
 
 
256 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
290 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
308 aa  169  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.22 
 
 
269 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  42.67 
 
 
276 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  47.52 
 
 
263 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.05 
 
 
269 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  51.58 
 
 
297 aa  169  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  44.3 
 
 
259 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  49.26 
 
 
265 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  46.79 
 
 
279 aa  167  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  50.54 
 
 
287 aa  167  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  47.03 
 
 
278 aa  167  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  47.78 
 
 
278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.74 
 
 
258 aa  167  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
261 aa  166  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  50.27 
 
 
253 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  44.09 
 
 
262 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  45.58 
 
 
272 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  50.27 
 
 
253 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  45.02 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  47.29 
 
 
333 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  50.54 
 
 
255 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
281 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  45.12 
 
 
315 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  44.13 
 
 
253 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  43.53 
 
 
282 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2449  ABC transporter related  50.53 
 
 
255 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  49.49 
 
 
284 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  43.75 
 
 
273 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  42.92 
 
 
361 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  47.8 
 
 
272 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3281  ABC transporter related  42.98 
 
 
261 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  48.92 
 
 
293 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  48.92 
 
 
293 aa  163  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.94 
 
 
258 aa  163  6e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  48.04 
 
 
264 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  45.5 
 
 
289 aa  163  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  50.26 
 
 
278 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0384  ABC transporter related  47.06 
 
 
288 aa  163  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  46.57 
 
 
255 aa  163  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  44.54 
 
 
291 aa  163  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  43.3 
 
 
271 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  42.5 
 
 
288 aa  162  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.6 
 
 
307 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 
267 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  46.15 
 
 
289 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0424  ABC transporter related protein  48.7 
 
 
254 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.573696  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  43.51 
 
 
279 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  46.11 
 
 
265 aa  162  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  47.98 
 
 
275 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  43.51 
 
 
279 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  46.04 
 
 
295 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.85 
 
 
267 aa  162  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  42.61 
 
 
284 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  46.31 
 
 
262 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  48.22 
 
 
297 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  46.67 
 
 
261 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  46.15 
 
 
284 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.38 
 
 
254 aa  160  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.83 
 
 
263 aa  160  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  44.71 
 
 
258 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  42.79 
 
 
306 aa  160  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.34 
 
 
324 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  46.5 
 
 
292 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
299 aa  160  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  45 
 
 
284 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  46.24 
 
 
263 aa  160  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45.37 
 
 
273 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>