More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1076 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1076  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 488 aa  956    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.276573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0817  ABC transporter related protein  77.14 
 
 		 492 aa  687    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0111  ABC transporter related  51.45 
 
 		 493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  49.1 
 
 		 259 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  51.76 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  44.57 
 
 		 258 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  48.42 
 
 		 272 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  50.7 
 
 		 255 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  50.5 
 
 		 253 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  46.19 
 
 		 272 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  43.84 
 
 		 308 aa  178  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 		 281 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 252 aa  177  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  49.75 
 
 		 269 aa  177  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.83 
 
 		 280 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  176  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  44.05 
 
 		 257 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  49.49 
 
 		 288 aa  176  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  45.5 
 
 		 263 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  50.7 
 
 		 253 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  50.7 
 
 		 253 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  50 
 
 		 252 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  46.36 
 
 		 259 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  44.64 
 
 		 263 aa  174  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  30.9 
 
 		 578 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0424  ABC transporter related protein  48.98 
 
 		 254 aa  173  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.573696  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2449  ABC transporter related  49.28 
 
 		 255 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  48.26 
 
 		 278 aa  173  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  44.72 
 
 		 256 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.7 
 
 		 269 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  50.8 
 
 		 297 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  48.02 
 
 		 266 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  45.87 
 
 		 254 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 276 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  43.05 
 
 		 258 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  43.8 
 
 		 260 aa  170  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  47.26 
 
 		 279 aa  170  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  42.15 
 
 		 261 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.48 
 
 		 258 aa  170  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.06 
 
 		 251 aa  170  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 275 aa  170  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.09 
 
 		 264 aa  170  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.97 
 
 		 263 aa  169  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  45.58 
 
 		 287 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  44.14 
 
 		 278 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 		 264 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  40.29 
 
 		 279 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  49.2 
 
 		 287 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  43.81 
 
 		 356 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  40.29 
 
 		 279 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  45.83 
 
 		 257 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  46.61 
 
 		 266 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 258 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  44.04 
 
 		 271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  46.46 
 
 		 301 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.51 
 
 		 267 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  42.37 
 
 		 276 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  45.63 
 
 		 256 aa  167  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  43.05 
 
 		 278 aa  167  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.19 
 
 		 263 aa  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  44.39 
 
 		 272 aa  167  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  44.05 
 
 		 269 aa  167  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  41.3 
 
 		 284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  42.41 
 
 		 290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 		 254 aa  166  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  48.13 
 
 		 293 aa  166  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  47.72 
 
 		 297 aa  166  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  48.13 
 
 		 293 aa  166  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  46.8 
 
 		 262 aa  166  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.5 
 
 		 271 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  41.7 
 
 		 265 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  43.58 
 
 		 271 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0384  ABC transporter related  46.31 
 
 		 288 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  43.23 
 
 		 273 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  45.7 
 
 		 265 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 		 261 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  47.06 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.47 
 
 		 254 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  43.53 
 
 		 241 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  44.89 
 
 		 287 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  47.59 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  44.7 
 
 		 267 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  44.71 
 
 		 284 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  47.15 
 
 		 261 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  40.91 
 
 		 306 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  45 
 
 		 307 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  42.59 
 
 		 262 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.29 
 
 		 254 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  45.45 
 
 		 275 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  45.24 
 
 		 295 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  44.5 
 
 		 261 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  42.86 
 
 		 333 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  44.97 
 
 		 273 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  42.01 
 
 		 283 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.86 
 
 		 258 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  44.6 
 
 		 273 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  41.26 
 
 		 284 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  44.44 
 
 		 262 aa  164  5.0000000000000005e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3456  ABC transporter related  49.76 
 
 		 252 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000578297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  43.12 
 
 		 278 aa  163  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>