More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0111 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0111  ABC transporter related  100 
 
 		 493 aa  953    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0817  ABC transporter related protein  51.97 
 
 		 492 aa  430  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1076  ABC transporter-like protein  51.03 
 
 		 488 aa  430  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.276573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  50.43 
 
 		 273 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  48.73 
 
 		 254 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  48.79 
 
 		 278 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  48.99 
 
 		 276 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  49.05 
 
 		 261 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  48.02 
 
 		 281 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  48.6 
 
 		 241 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  49 
 
 		 264 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.34 
 
 		 297 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.62 
 
 		 280 aa  167  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.15 
 
 		 259 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  48.32 
 
 		 291 aa  167  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 273 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 260 aa  166  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  47.3 
 
 		 292 aa  166  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  49.5 
 
 		 241 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  44.62 
 
 		 257 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  43.6 
 
 		 432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  50 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  44.78 
 
 		 301 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  36.99 
 
 		 254 aa  163  7e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.8 
 
 		 278 aa  163  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  48.74 
 
 		 278 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  49.51 
 
 		 244 aa  162  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1152  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  40.09 
 
 		 240 aa  162  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  40.49 
 
 		 265 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2449  ABC transporter related  50.53 
 
 		 255 aa  162  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  47.25 
 
 		 266 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  43.36 
 
 		 258 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  41.59 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.03 
 
 		 330 aa  162  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  45.7 
 
 		 256 aa  161  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 		 257 aa  161  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  49.2 
 
 		 253 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  49.2 
 
 		 253 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0670  ABC transporter related protein  46.57 
 
 		 258 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  48.82 
 
 		 255 aa  160  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  48.45 
 
 		 261 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.6 
 
 		 252 aa  160  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  44.64 
 
 		 255 aa  160  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  44 
 
 		 269 aa  160  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  42.92 
 
 		 264 aa  159  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 426 aa  159  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0658  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 245 aa  159  8e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  48.53 
 
 		 244 aa  159  9e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 		 270 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3817  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 249 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  47.4 
 
 		 262 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  44.75 
 
 		 265 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 263 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 278 aa  158  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.86 
 
 		 269 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  45.05 
 
 		 267 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  41.9 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  45.41 
 
 		 282 aa  158  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  45.85 
 
 		 252 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  45.5 
 
 		 265 aa  158  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  46.15 
 
 		 330 aa  158  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  45.27 
 
 		 269 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1611  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.63 
 
 		 423 aa  157  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.290813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  45.85 
 
 		 252 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  49.04 
 
 		 246 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  45.64 
 
 		 295 aa  157  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  46.15 
 
 		 319 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  45.73 
 
 		 269 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  42.21 
 
 		 271 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3412  ABC transporter related protein  48.07 
 
 		 258 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  45.21 
 
 		 299 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  41.43 
 
 		 333 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  46.5 
 
 		 276 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  39.64 
 
 		 254 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  46.31 
 
 		 319 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  46.31 
 
 		 319 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  45.18 
 
 		 290 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 		 271 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  45.37 
 
 		 252 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 		 333 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  43.78 
 
 		 271 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3541  ABC transporter related  47.12 
 
 		 255 aa  157  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  45.25 
 
 		 273 aa  157  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  45.05 
 
 		 260 aa  157  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  50.26 
 
 		 244 aa  157  6e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1237  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.55 
 
 		 273 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4373  ABC transporter related  47.45 
 
 		 297 aa  156  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 		 333 aa  156  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  45.81 
 
 		 318 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  43.22 
 
 		 251 aa  156  8e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10000  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49.76 
 
 		 241 aa  156  8e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0152878  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  42.22 
 
 		 275 aa  156  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0325  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.52 
 
 		 268 aa  156  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  43.95 
 
 		 267 aa  156  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0713  ABC transporter related protein  47.35 
 
 		 265 aa  156  9e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  40.54 
 
 		 262 aa  156  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  40.81 
 
 		 279 aa  156  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  44.71 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 		 333 aa  156  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0832  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.83 
 
 		 266 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0180389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>