More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3541 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3541  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  520  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774244  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5730  ABC transporter related  47.92 
 
 
259 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5351  ABC transporter related  47.92 
 
 
262 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5440  ABC transporter related  47.92 
 
 
262 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  45.93 
 
 
267 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  46.56 
 
 
261 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34330  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.22 
 
 
262 aa  225  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0104  ABC transporter related  47.01 
 
 
260 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0384  ABC transporter related  47.86 
 
 
288 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  47.58 
 
 
260 aa  222  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  51.54 
 
 
297 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5421  ABC transporter related  44.53 
 
 
294 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  43.37 
 
 
290 aa  216  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  42.8 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  47.77 
 
 
273 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  48.95 
 
 
292 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.82 
 
 
304 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  42.4 
 
 
308 aa  206  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0235  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.22 
 
 
267 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  43.82 
 
 
304 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  44.94 
 
 
315 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0256  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.43 
 
 
267 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.378501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.91 
 
 
267 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.91 
 
 
267 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  42.63 
 
 
306 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.49 
 
 
251 aa  202  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.94 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03652  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  40.08 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  48.97 
 
 
278 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2480  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  44.59 
 
 
257 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3269  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.8 
 
 
270 aa  198  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.454908  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 
264 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1440  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.4 
 
 
264 aa  198  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  47.19 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2322  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.4 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2833  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.23 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.24141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0379  putative nitrate ATP-binding ABC transporter protein  43.03 
 
 
268 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.95656 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  43.6 
 
 
263 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.16 
 
 
252 aa  196  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2375  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42 
 
 
268 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  44.89 
 
 
274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  41.67 
 
 
272 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0325  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  40.89 
 
 
268 aa  195  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  42.13 
 
 
260 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  42.21 
 
 
304 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  44.93 
 
 
307 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 
254 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2274  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.13 
 
 
265 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362973  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  44.1 
 
 
258 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0667  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.29 
 
 
266 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.024802 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  42.23 
 
 
303 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42 
 
 
269 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7248  ABC transporter ATP-binding protein  46.48 
 
 
222 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00375076  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  45.22 
 
 
253 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2907  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.87 
 
 
262 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.98485  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  42.23 
 
 
303 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  42.23 
 
 
303 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
267 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6161  ABC transporter related  41.7 
 
 
287 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.551746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  45.12 
 
 
269 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  45.22 
 
 
253 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1390  NO3-/NO2- ABC transporter  40.55 
 
 
266 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0832  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  40.96 
 
 
266 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0180389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
263 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  44.35 
 
 
259 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  40.41 
 
 
260 aa  192  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  40.93 
 
 
265 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2415  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.68 
 
 
284 aa  192  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.247099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.37 
 
 
263 aa  191  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2323  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.27 
 
 
262 aa  191  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1412  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.8 
 
 
271 aa  191  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.867581  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4569  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.24 
 
 
275 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571931  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  40.73 
 
 
264 aa  191  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  38.55 
 
 
276 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.08 
 
 
669 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3841  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.62 
 
 
278 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  41.43 
 
 
259 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  42.26 
 
 
280 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  43.04 
 
 
257 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  42.56 
 
 
275 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  44.31 
 
 
256 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  41.3 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  45.22 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  41.27 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2556  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.64 
 
 
274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.140772  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.68 
 
 
668 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2495  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.8 
 
 
264 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0481229  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2338  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.04 
 
 
276 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  41.73 
 
 
259 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  41.53 
 
 
263 aa  189  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2731  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.4 
 
 
264 aa  189  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.325521  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1543  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.4 
 
 
264 aa  188  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 
252 aa  188  9e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  43.98 
 
 
264 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  43.51 
 
 
260 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  44.5 
 
 
287 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3454  ABC transporter related  42.64 
 
 
282 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162103  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>