More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17280 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_17280  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  100 
 
 
325 aa  637    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158115  normal  0.544115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.06 
 
 
317 aa  315  7e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0255815  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.56 
 
 
453 aa  300  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.34 
 
 
281 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695693  normal  0.331928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.67 
 
 
300 aa  276  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000896674  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.89 
 
 
264 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32312  normal  0.0411868 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
277 aa  155  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
285 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13305  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
267 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318809  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0801  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  33.78 
 
 
298 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745387  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
268 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1263  ABC transporter permease  36.16 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
283 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
257 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
285 aa  126  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0792607  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  34.01 
 
 
250 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  34.98 
 
 
250 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
267 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2015  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  35.68 
 
 
252 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3210  ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
267 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  34.98 
 
 
250 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  34.98 
 
 
250 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  34.98 
 
 
250 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
275 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
250 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  34.53 
 
 
250 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  33.2 
 
 
251 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
284 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.65192 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.1 
 
 
278 aa  122  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
251 aa  122  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00381914  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
264 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0240883  normal  0.166534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
264 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
280 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
264 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
250 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 
273 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3552  ABC transporter membrane spanning protein  32.6 
 
 
285 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
246 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3414  ATP-binding protein of ABC transporter  35.84 
 
 
280 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
273 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2099  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0258  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.92 
 
 
274 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
222 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
250 aa  109  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
253 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.87 
 
 
283 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2545  binding-protein-dependent transport system protein  33.04 
 
 
287 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240068  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3460  ABC transporter membrane spanning protein  32.7 
 
 
288 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.23 
 
 
261 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
274 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
268 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  31.67 
 
 
247 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
250 aa  105  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
362 aa  105  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
286 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
288 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
289 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.78 
 
 
284 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.77 
 
 
281 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
258 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0111  ABC transporter related  34.21 
 
 
493 aa  102  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
260 aa  102  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7480  ABC transporter permease  34.82 
 
 
271 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.131238 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
247 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0817  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
492 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1076  ABC transporter-like protein  30.64 
 
 
488 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
322 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.167871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
274 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0627389  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
258 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121812  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02100  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  31.28 
 
 
308 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
275 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
375 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3455  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.26 
 
 
322 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833863  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
262 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
254 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.404323  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  34.21 
 
 
249 aa  99.8  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
275 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  28.31 
 
 
266 aa  99.4  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
277 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
256 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120198  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  28.31 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
282 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.173855  normal  0.365472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.433007  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
245 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  31.63 
 
 
265 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
252 aa  97.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21476  normal  0.0147088 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>