More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0259 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 453 aa  901    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17280  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  51.22 
 
 		 325 aa  296  7e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158115  normal  0.544115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.49 
 
 		 317 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0255815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.81 
 
 		 300 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000896674  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.95 
 
 		 281 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695693  normal  0.331928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.7 
 
 		 264 aa  236  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32312  normal  0.0411868 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 		 277 aa  146  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  53.54 
 
 		 274 aa  143  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3789  ABC transporter related  60.33 
 
 		 254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0962243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2280  ABC transporter related  54.55 
 
 		 257 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16771  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 		 267 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 		 275 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 		 268 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 		 285 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0792607  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 		 267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3210  ABC transporter, permease protein  37.84 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 		 283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2545  binding-protein-dependent transport system protein  32.61 
 
 		 287 aa  120  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240068  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 		 264 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0801  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  33.33 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1076  ABC transporter-like protein  30.54 
 
 		 488 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.276573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4057  ABC transporter related  47.52 
 
 		 288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 		 264 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0240883  normal  0.166534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  51.92 
 
 		 233 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 		 284 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.65192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  46.27 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 		 285 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  41.61 
 
 		 268 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0817  ABC transporter related protein  34.03 
 
 		 492 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 		 253 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208081  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  41.26 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 		 267 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2015  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  33.19 
 
 		 252 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.97 
 
 		 261 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0111  ABC transporter related  34.22 
 
 		 493 aa  113  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 		 250 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3552  ABC transporter membrane spanning protein  35.09 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1263  ABC transporter permease  34.29 
 
 		 262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  35.94 
 
 		 250 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  47.58 
 
 		 267 aa  111  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  35.94 
 
 		 250 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  35.94 
 
 		 250 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  35.94 
 
 		 250 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.31 
 
 		 276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  43.04 
 
 		 261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 		 282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 		 250 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  48.76 
 
 		 271 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  45.3 
 
 		 241 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  35.26 
 
 		 250 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.64 
 
 		 258 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  45.67 
 
 		 267 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.56 
 
 		 283 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  42.52 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 		 287 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00381914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3166  ABC transporter, inner membrane subunit  35.36 
 
 		 281 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  45.97 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 		 282 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.41 
 
 		 254 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  50.39 
 
 		 257 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  46.97 
 
 		 275 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 		 251 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 		 281 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  43.48 
 
 		 261 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 		 251 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.41 
 
 		 254 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  46.51 
 
 		 270 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  43.36 
 
 		 280 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 		 251 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0773  ABC transporter related  48.92 
 
 		 262 aa  106  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  43.9 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  46.27 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.7 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  43.36 
 
 		 265 aa  106  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  41.09 
 
 		 252 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  47.15 
 
 		 246 aa  106  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  47.15 
 
 		 282 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.62 
 
 		 277 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0258  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 		 274 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  48.41 
 
 		 273 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.167871 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.64 
 
 		 254 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44.27 
 
 		 259 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.1 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.89 
 
 		 259 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 		 253 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  42.75 
 
 		 284 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  45.77 
 
 		 278 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 256 aa  104  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.59 
 
 		 271 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  44.36 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  51.54 
 
 		 258 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3900  ABC transporter related  41.86 
 
 		 228 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  46.22 
 
 		 252 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>