More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3788 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
317 aa  620  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0255815  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17280  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  62.06 
 
 
325 aa  315  6e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158115  normal  0.544115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.49 
 
 
453 aa  265  8e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.6 
 
 
281 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695693  normal  0.331928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.06 
 
 
300 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000896674  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.99 
 
 
264 aa  228  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32312  normal  0.0411868 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
277 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0801  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  34.48 
 
 
298 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745387  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
268 aa  138  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3210  ABC transporter, permease protein  38.39 
 
 
267 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
267 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318809  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
267 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.78 
 
 
275 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2015  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  38.39 
 
 
252 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208081  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1263  ABC transporter permease  36.61 
 
 
262 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 
251 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
283 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  32.16 
 
 
250 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  33.92 
 
 
250 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  33.48 
 
 
250 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  33.92 
 
 
250 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  33.92 
 
 
250 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  33.92 
 
 
250 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3552  ABC transporter membrane spanning protein  34.51 
 
 
285 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 
250 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 
251 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
285 aa  122  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0792607  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
264 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0240883  normal  0.166534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
264 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
251 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3414  ATP-binding protein of ABC transporter  35.77 
 
 
280 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
285 aa  119  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13305  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
257 aa  119  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.167871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.404323  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 
279 aa  116  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40 
 
 
278 aa  113  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2545  binding-protein-dependent transport system protein  32.77 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240068  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
284 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.65192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.93 
 
 
261 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
286 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00381914  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
289 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2099  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 
306 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
253 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.54 
 
 
259 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  31.4 
 
 
266 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
375 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.149558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7480  ABC transporter permease  40.57 
 
 
271 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.131238 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.58 
 
 
263 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120198  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
272 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.025765  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  31.42 
 
 
266 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
255 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
274 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000362296  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
260 aa  105  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 
255 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
281 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
246 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  33.66 
 
 
257 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
256 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  33.84 
 
 
265 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  33.84 
 
 
265 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 
258 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  34.25 
 
 
257 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1076  ABC transporter-like protein  32.98 
 
 
488 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
273 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
272 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  33.84 
 
 
265 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 
362 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  33.84 
 
 
257 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  33.84 
 
 
257 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
298 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.433007  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
273 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
274 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  33.17 
 
 
257 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3460  ABC transporter membrane spanning protein  32.74 
 
 
288 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
266 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.913641  normal  0.0426886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  30.64 
 
 
265 aa  103  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
222 aa  102  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
258 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
250 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
272 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0258  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
274 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30.28 
 
 
249 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3166  ABC transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 
281 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.2 
 
 
263 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 
281 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
255 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.89 
 
 
258 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>