More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3414 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3414  ATP-binding protein of ABC transporter  100 
 
 
280 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.42 
 
 
294 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.94 
 
 
280 aa  338  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208081  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.27 
 
 
298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.433007  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0801  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  55.95 
 
 
298 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745387  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.54 
 
 
283 aa  267  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.45 
 
 
287 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00381914  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.77 
 
 
268 aa  264  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.9 
 
 
284 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.65192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.55 
 
 
285 aa  260  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0792607  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3552  ABC transporter membrane spanning protein  53.12 
 
 
285 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.62 
 
 
285 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13305  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.89 
 
 
279 aa  242  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 
267 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318809  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.58 
 
 
278 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.57 
 
 
274 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0258  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.94 
 
 
274 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 
264 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0240883  normal  0.166534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1263  ABC transporter permease  47.22 
 
 
262 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 
264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7480  ABC transporter permease  54.32 
 
 
271 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.131238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3210  ABC transporter, permease protein  48.71 
 
 
267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.02 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.71 
 
 
267 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.25 
 
 
274 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0627389  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2015  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  46.83 
 
 
252 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.36 
 
 
276 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.42 
 
 
262 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.93 
 
 
254 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.404323  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
277 aa  145  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
254 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.77 
 
 
252 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21476  normal  0.0147088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
275 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
317 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0255815  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
281 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695693  normal  0.331928 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32312  normal  0.0411868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17280  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  35.84 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158115  normal  0.544115 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.12 
 
 
263 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.48 
 
 
284 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
254 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
277 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  33.74 
 
 
266 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  33.33 
 
 
266 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
272 aa  118  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
272 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.025765  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
453 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
258 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0347556  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
258 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
273 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.75 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
300 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000896674  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.91 
 
 
259 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
281 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58323  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
271 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  29.8 
 
 
265 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02100  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  32.59 
 
 
308 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
275 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
255 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
281 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.1 
 
 
255 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.71 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
250 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
303 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.674946  normal  0.833857 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
257 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.82 
 
 
257 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  33.87 
 
 
250 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 
287 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.66 
 
 
258 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  33.87 
 
 
250 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 
250 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30.42 
 
 
249 aa  105  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  33.87 
 
 
250 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  33.87 
 
 
250 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3460  ABC transporter membrane spanning protein  33.07 
 
 
288 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
286 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 
250 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 
282 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0528385  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 
251 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  32.88 
 
 
282 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
258 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121812  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
246 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0488  putative binding protein-dependent transport system, membrane component  31.97 
 
 
272 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.970837  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3459  ABC transporter  34.83 
 
 
288 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
270 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
267 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549296  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  33.47 
 
 
250 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
305 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856164  normal  0.860518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>