More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0666 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
272 aa  523  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.72 
 
 
272 aa  417  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.44 
 
 
272 aa  358  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.025765  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.78 
 
 
246 aa  201  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.57 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.173855  normal  0.365472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
268 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
256 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  41.3 
 
 
265 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  41.3 
 
 
265 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  41.3 
 
 
265 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  40.87 
 
 
257 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  41.3 
 
 
257 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  41.3 
 
 
257 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 
257 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 
257 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.96 
 
 
259 aa  186  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
254 aa  185  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
255 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  40.87 
 
 
255 aa  185  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.09 
 
 
278 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
249 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.56 
 
 
250 aa  178  9e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
253 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
283 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  38.79 
 
 
249 aa  176  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  39.76 
 
 
250 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  40.16 
 
 
251 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  40.16 
 
 
251 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
250 aa  171  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  40.16 
 
 
250 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
250 aa  169  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  39.76 
 
 
250 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  39.76 
 
 
250 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  39.76 
 
 
250 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  39.76 
 
 
250 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  39.36 
 
 
250 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
254 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.54 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.946292  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
222 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.32 
 
 
284 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.83 
 
 
254 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
259 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.805205  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
257 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
260 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566245  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  35.69 
 
 
266 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
274 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  34.08 
 
 
266 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
273 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  37.45 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.77 
 
 
258 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.674946  normal  0.833857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.44 
 
 
259 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0488  putative binding protein-dependent transport system, membrane component  37.87 
 
 
272 aa  142  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.970837  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
271 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
375 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.149558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0467336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.21 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58323  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
375 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
281 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3460  ABC transporter membrane spanning protein  36.29 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
263 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
257 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2545  binding-protein-dependent transport system protein  37.5 
 
 
287 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240068  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6031  putative ABC transporter, permease protein  36.48 
 
 
325 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 
286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113814  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783663  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  33.91 
 
 
265 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
256 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
277 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  36.36 
 
 
282 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
249 aa  132  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.04587  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1076  ABC transporter-like protein  36.84 
 
 
488 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0528385  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
362 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
253 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0347556  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0817  ABC transporter related protein  35.05 
 
 
492 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  37.55 
 
 
247 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0654  ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>