More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3181 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
277 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.12 
 
 
281 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.83 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.15 
 
 
273 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.72 
 
 
273 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  44.78 
 
 
282 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  39.63 
 
 
279 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
270 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
257 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  39.09 
 
 
250 aa  168  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  37.45 
 
 
251 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
274 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  37.45 
 
 
250 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  37.86 
 
 
250 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  37.86 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  37.86 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  37.86 
 
 
250 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  37.86 
 
 
250 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  37.45 
 
 
251 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  38.22 
 
 
266 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  37.25 
 
 
266 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.21 
 
 
284 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
250 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
250 aa  159  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  35.91 
 
 
265 aa  158  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
283 aa  158  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
271 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
246 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2545  binding-protein-dependent transport system protein  36.44 
 
 
287 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240068  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
247 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0488  putative binding protein-dependent transport system, membrane component  40.34 
 
 
272 aa  152  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.970837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  32.54 
 
 
257 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
265 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  32.54 
 
 
255 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
257 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
255 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
256 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
254 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
268 aa  149  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
293 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.877762  normal  0.739003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
282 aa  148  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  30.62 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  30.62 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  31.35 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  31.35 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  31.35 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  30.62 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  31.35 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3166  ABC transporter, inner membrane subunit  35.82 
 
 
281 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
258 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121812  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
280 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208081  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  36.73 
 
 
247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
281 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
293 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
260 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566245  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
280 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0794658  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3330  ABC transporter membrane spanning protein  31.94 
 
 
295 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
253 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
258 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.2 
 
 
259 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
258 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 
276 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
267 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549296  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 
276 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
267 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318809  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 
264 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.025765  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
255 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
253 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0240883  normal  0.166534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
268 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
259 aa  132  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
267 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0801  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  34.68 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745387  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
274 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00112224  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
275 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
257 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2015  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  35.74 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0347556  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.56 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
266 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.913641  normal  0.0426886 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
278 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
258 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>