More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5061 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 293 aa  586  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.877762  normal  0.739003 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.9 
 
 		 293 aa  567  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7364 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3330  ABC transporter membrane spanning protein  80 
 
 		 295 aa  481  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.02 
 
 		 294 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0684117  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.19 
 
 		 295 aa  326  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.98 
 
 		 295 aa  316  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.63 
 
 		 287 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0493  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  59.33 
 
 		 287 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.33 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.72 
 
 		 285 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.78 
 
 		 285 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.090458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.78 
 
 		 282 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.78 
 
 		 285 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3216  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  55.72 
 
 		 285 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0037  ABC transporter, permease protein  56.25 
 
 		 259 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.18 
 
 		 285 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.78 
 
 		 282 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2678  ABC transporter, permease protein  57.14 
 
 		 285 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0253  ABC transporter, permease protein  57.14 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.735185  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3274  ABC transporter, permease protein  57.14 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1853  ABC transporter, permease protein  57.14 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0040  ABC transporter, permease protein  57.14 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0040  ABC transporter, permease protein  57.14 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.522623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2699  ABC transporter, permease protein  57.14 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.09 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.23 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.033554  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3278  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000407876  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 		 276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 		 276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.22 
 
 		 263 aa  208  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.22 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.48 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1200  transmembrane permease ABC transporter protein  44 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.441856  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2355  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  41.45 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214574  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.5 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 		 274 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.146122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.02 
 
 		 264 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0261  ABC transporter, permease protein  43.24 
 
 		 263 aa  198  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 		 263 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243564  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.5 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324199  normal  0.863766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0285  ABC transporter, permease protein  42.47 
 
 		 263 aa  195  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 		 279 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2103  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.98 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6067  ABC transporter permease  41.15 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2107  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.43 
 
 		 265 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 		 329 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3334  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.92 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.227064  normal  0.190195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0794658  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 		 279 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 		 279 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000965537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.101401  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 		 292 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 		 272 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.36 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 		 273 aa  136  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1306  ABC transporter, permease component  32.62 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 		 268 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133558  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.19 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  31.76 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.89 
 
 		 269 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 		 281 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  0.608264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4677  ABC transporter permease  31.11 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4536  ABC transporter, permease  31.11 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5038  ABC transporter permease  31.11 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4902  ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0335  ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4903  ABC transporter, permease protein  30.67 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 		 270 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00112224  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4937  ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 		 271 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  27.24 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  27.24 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  27.24 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  27.24 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>